Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SEMA4BQ9NPR2 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms