Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FANCFQ9NPI8 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
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