Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP86

CABP5, Calcium-binding protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP5Q9NP86 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CABP5Q9NP86 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CABP5Q9NP86 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CABP5Q9NP86 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CABP5Q9NP86 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CABP5Q9NP86 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CABP5Q9NP86 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CABP5Q9NP86 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CABP5Q9NP86 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CABP5Q9NP86 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CABP5Q9NP86 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CABP5Q9NP86 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CABP5Q9NP86 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CABP5Q9NP86 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CABP5Q9NP86 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CABP5Q9NP86 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CABP5Q9NP86 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CABP5Q9NP86 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CABP5Q9NP86 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CABP5Q9NP86 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CABP5Q9NP86 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CABP5Q9NP86 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CABP5Q9NP86 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CABP5Q9NP86 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CABP5Q9NP86 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CABP5Q9NP86 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CABP5Q9NP86 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CABP5Q9NP86 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CABP5Q9NP86 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CABP5Q9NP86 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CABP5Q9NP86 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CABP5Q9NP86 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CABP5Q9NP86 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CABP5Q9NP86 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CABP5Q9NP86 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CABP5Q9NP86 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CABP5Q9NP86 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CABP5Q9NP86 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CABP5Q9NP86 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CABP5Q9NP86 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CABP5Q9NP86 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CABP5Q9NP86 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CABP5Q9NP86 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CABP5Q9NP86 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CABP5Q9NP86 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CABP5Q9NP86 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CABP5Q9NP86 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CABP5Q9NP86 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CABP5Q9NP86 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CABP5Q9NP86 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CABP5Q9NP86 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CABP5Q9NP86 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CABP5Q9NP86 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CABP5Q9NP86 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CABP5Q9NP86 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CABP5Q9NP86 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CABP5Q9NP86 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CABP5Q9NP86 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CABP5Q9NP86 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CABP5Q9NP86 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CABP5Q9NP86 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CABP5Q9NP86 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CABP5Q9NP86 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CABP5Q9NP86 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CABP5Q9NP86 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CABP5Q9NP86 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CABP5Q9NP86 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CABP5Q9NP86 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CABP5Q9NP86 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CABP5Q9NP86 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CABP5Q9NP86 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CABP5Q9NP86 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CABP5Q9NP86 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CABP5Q9NP86 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CABP5Q9NP86 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CABP5Q9NP86 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CABP5Q9NP86 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CABP5Q9NP86 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CABP5Q9NP86 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CABP5Q9NP86 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CABP5Q9NP86 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CABP5Q9NP86 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CABP5Q9NP86 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CABP5Q9NP86 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CABP5Q9NP86 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CABP5Q9NP86 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CABP5Q9NP86 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CABP5Q9NP86 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CABP5Q9NP86 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CABP5Q9NP86 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CABP5Q9NP86 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CABP5Q9NP86 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CABP5Q9NP86 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CABP5Q9NP86 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CABP5Q9NP86 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CABP5Q9NP86 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CABP5Q9NP86 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CABP5Q9NP86 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CABP5Q9NP86 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CABP5Q9NP86 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms