Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD43

PTPRH, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase H, humanhuman

Predictions only

Length 1,115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRHQ9HD43 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRHQ9HD43 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRHQ9HD43 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRHQ9HD43 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRHQ9HD43 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRHQ9HD43 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRHQ9HD43 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRHQ9HD43 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRHQ9HD43 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRHQ9HD43 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRHQ9HD43 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRHQ9HD43 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRHQ9HD43 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRHQ9HD43 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRHQ9HD43 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRHQ9HD43 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRHQ9HD43 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRHQ9HD43 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRHQ9HD43 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRHQ9HD43 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRHQ9HD43 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRHQ9HD43 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRHQ9HD43 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRHQ9HD43 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRHQ9HD43 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRHQ9HD43 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRHQ9HD43 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRHQ9HD43 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRHQ9HD43 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRHQ9HD43 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRHQ9HD43 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRHQ9HD43 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRHQ9HD43 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRHQ9HD43 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRHQ9HD43 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRHQ9HD43 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRHQ9HD43 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRHQ9HD43 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRHQ9HD43 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRHQ9HD43 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRHQ9HD43 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRHQ9HD43 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRHQ9HD43 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRHQ9HD43 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRHQ9HD43 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PTPRHQ9HD43 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PTPRHQ9HD43 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRHQ9HD43 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRHQ9HD43 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRHQ9HD43 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRHQ9HD43 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRHQ9HD43 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRHQ9HD43 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRHQ9HD43 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRHQ9HD43 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRHQ9HD43 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRHQ9HD43 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRHQ9HD43 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRHQ9HD43 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRHQ9HD43 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRHQ9HD43 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRHQ9HD43 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRHQ9HD43 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRHQ9HD43 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRHQ9HD43 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRHQ9HD43 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRHQ9HD43 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRHQ9HD43 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRHQ9HD43 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRHQ9HD43 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRHQ9HD43 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRHQ9HD43 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRHQ9HD43 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRHQ9HD43 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRHQ9HD43 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRHQ9HD43 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRHQ9HD43 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRHQ9HD43 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRHQ9HD43 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRHQ9HD43 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRHQ9HD43 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRHQ9HD43 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRHQ9HD43 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRHQ9HD43 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRHQ9HD43 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRHQ9HD43 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRHQ9HD43 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRHQ9HD43 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRHQ9HD43 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRHQ9HD43 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRHQ9HD43 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRHQ9HD43 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRHQ9HD43 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRHQ9HD43 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRHQ9HD43 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRHQ9HD43 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRHQ9HD43 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPRHQ9HD43 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRHQ9HD43 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPRHQ9HD43 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
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