Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ0

TNRC6C, Trinucleotide repeat-containing gene 6C protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRC6CQ9HCJ0 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNRC6CQ9HCJ0 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNRC6CQ9HCJ0 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNRC6CQ9HCJ0 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TNRC6CQ9HCJ0 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNRC6CQ9HCJ0 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNRC6CQ9HCJ0 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNRC6CQ9HCJ0 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNRC6CQ9HCJ0 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TNRC6CQ9HCJ0 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNRC6CQ9HCJ0 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TNRC6CQ9HCJ0 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TNRC6CQ9HCJ0 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNRC6CQ9HCJ0 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNRC6CQ9HCJ0 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNRC6CQ9HCJ0 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNRC6CQ9HCJ0 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNRC6CQ9HCJ0 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNRC6CQ9HCJ0 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNRC6CQ9HCJ0 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNRC6CQ9HCJ0 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNRC6CQ9HCJ0 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNRC6CQ9HCJ0 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TNRC6CQ9HCJ0 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNRC6CQ9HCJ0 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNRC6CQ9HCJ0 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNRC6CQ9HCJ0 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNRC6CQ9HCJ0 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNRC6CQ9HCJ0 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNRC6CQ9HCJ0 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNRC6CQ9HCJ0 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNRC6CQ9HCJ0 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNRC6CQ9HCJ0 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNRC6CQ9HCJ0 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNRC6CQ9HCJ0 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNRC6CQ9HCJ0 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNRC6CQ9HCJ0 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNRC6CQ9HCJ0 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNRC6CQ9HCJ0 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNRC6CQ9HCJ0 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNRC6CQ9HCJ0 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNRC6CQ9HCJ0 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNRC6CQ9HCJ0 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNRC6CQ9HCJ0 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNRC6CQ9HCJ0 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNRC6CQ9HCJ0 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNRC6CQ9HCJ0 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNRC6CQ9HCJ0 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNRC6CQ9HCJ0 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNRC6CQ9HCJ0 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNRC6CQ9HCJ0 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNRC6CQ9HCJ0 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNRC6CQ9HCJ0 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNRC6CQ9HCJ0 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNRC6CQ9HCJ0 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNRC6CQ9HCJ0 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNRC6CQ9HCJ0 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNRC6CQ9HCJ0 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNRC6CQ9HCJ0 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNRC6CQ9HCJ0 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNRC6CQ9HCJ0 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TNRC6CQ9HCJ0 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNRC6CQ9HCJ0 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TNRC6CQ9HCJ0 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNRC6CQ9HCJ0 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNRC6CQ9HCJ0 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNRC6CQ9HCJ0 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNRC6CQ9HCJ0 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNRC6CQ9HCJ0 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TNRC6CQ9HCJ0 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNRC6CQ9HCJ0 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNRC6CQ9HCJ0 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TNRC6CQ9HCJ0 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TNRC6CQ9HCJ0 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TNRC6CQ9HCJ0 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TNRC6CQ9HCJ0 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TNRC6CQ9HCJ0 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TNRC6CQ9HCJ0 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TNRC6CQ9HCJ0 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TNRC6CQ9HCJ0 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TNRC6CQ9HCJ0 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNRC6CQ9HCJ0 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNRC6CQ9HCJ0 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNRC6CQ9HCJ0 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNRC6CQ9HCJ0 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNRC6CQ9HCJ0 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNRC6CQ9HCJ0 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TNRC6CQ9HCJ0 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNRC6CQ9HCJ0 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNRC6CQ9HCJ0 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TNRC6CQ9HCJ0 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNRC6CQ9HCJ0 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNRC6CQ9HCJ0 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNRC6CQ9HCJ0 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNRC6CQ9HCJ0 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNRC6CQ9HCJ0 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNRC6CQ9HCJ0 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNRC6CQ9HCJ0 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNRC6CQ9HCJ0 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNRC6CQ9HCJ0 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms