Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAB3

SLC52A2, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A2Q9HAB3 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC52A2Q9HAB3 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC52A2Q9HAB3 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC52A2Q9HAB3 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC52A2Q9HAB3 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC52A2Q9HAB3 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC52A2Q9HAB3 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC52A2Q9HAB3 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC52A2Q9HAB3 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC52A2Q9HAB3 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC52A2Q9HAB3 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC52A2Q9HAB3 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC52A2Q9HAB3 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC52A2Q9HAB3 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC52A2Q9HAB3 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC52A2Q9HAB3 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC52A2Q9HAB3 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC52A2Q9HAB3 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC52A2Q9HAB3 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC52A2Q9HAB3 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC52A2Q9HAB3 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC52A2Q9HAB3 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC52A2Q9HAB3 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC52A2Q9HAB3 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC52A2Q9HAB3 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC52A2Q9HAB3 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC52A2Q9HAB3 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC52A2Q9HAB3 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC52A2Q9HAB3 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC52A2Q9HAB3 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC52A2Q9HAB3 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC52A2Q9HAB3 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC52A2Q9HAB3 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC52A2Q9HAB3 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC52A2Q9HAB3 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC52A2Q9HAB3 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC52A2Q9HAB3 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC52A2Q9HAB3 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC52A2Q9HAB3 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC52A2Q9HAB3 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC52A2Q9HAB3 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC52A2Q9HAB3 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC52A2Q9HAB3 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC52A2Q9HAB3 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC52A2Q9HAB3 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC52A2Q9HAB3 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC52A2Q9HAB3 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC52A2Q9HAB3 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC52A2Q9HAB3 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC52A2Q9HAB3 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC52A2Q9HAB3 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC52A2Q9HAB3 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC52A2Q9HAB3 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC52A2Q9HAB3 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC52A2Q9HAB3 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC52A2Q9HAB3 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC52A2Q9HAB3 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC52A2Q9HAB3 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC52A2Q9HAB3 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC52A2Q9HAB3 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC52A2Q9HAB3 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC52A2Q9HAB3 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC52A2Q9HAB3 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC52A2Q9HAB3 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC52A2Q9HAB3 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC52A2Q9HAB3 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC52A2Q9HAB3 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC52A2Q9HAB3 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC52A2Q9HAB3 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC52A2Q9HAB3 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC52A2Q9HAB3 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC52A2Q9HAB3 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC52A2Q9HAB3 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC52A2Q9HAB3 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC52A2Q9HAB3 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC52A2Q9HAB3 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC52A2Q9HAB3 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC52A2Q9HAB3 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC52A2Q9HAB3 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC52A2Q9HAB3 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC52A2Q9HAB3 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC52A2Q9HAB3 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC52A2Q9HAB3 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC52A2Q9HAB3 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC52A2Q9HAB3 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC52A2Q9HAB3 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC52A2Q9HAB3 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC52A2Q9HAB3 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC52A2Q9HAB3 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC52A2Q9HAB3 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC52A2Q9HAB3 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC52A2Q9HAB3 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC52A2Q9HAB3 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC52A2Q9HAB3 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC52A2Q9HAB3 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC52A2Q9HAB3 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC52A2Q9HAB3 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC52A2Q9HAB3 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC52A2Q9HAB3 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC52A2Q9HAB3 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms