Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D5

NXF3, Nuclear RNA export factor 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 531 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXF3Q9H4D5 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NXF3Q9H4D5 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NXF3Q9H4D5 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NXF3Q9H4D5 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NXF3Q9H4D5 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NXF3Q9H4D5 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
NXF3Q9H4D5 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NXF3Q9H4D5 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NXF3Q9H4D5 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NXF3Q9H4D5 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NXF3Q9H4D5 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NXF3Q9H4D5 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NXF3Q9H4D5 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NXF3Q9H4D5 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NXF3Q9H4D5 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NXF3Q9H4D5 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NXF3Q9H4D5 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NXF3Q9H4D5 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NXF3Q9H4D5 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NXF3Q9H4D5 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NXF3Q9H4D5 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NXF3Q9H4D5 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
NXF3Q9H4D5 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
NXF3Q9H4D5 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NXF3Q9H4D5 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NXF3Q9H4D5 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
NXF3Q9H4D5 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
NXF3Q9H4D5 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NXF3Q9H4D5 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NXF3Q9H4D5 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NXF3Q9H4D5 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NXF3Q9H4D5 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NXF3Q9H4D5 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NXF3Q9H4D5 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NXF3Q9H4D5 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NXF3Q9H4D5 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NXF3Q9H4D5 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NXF3Q9H4D5 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NXF3Q9H4D5 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NXF3Q9H4D5 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NXF3Q9H4D5 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NXF3Q9H4D5 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NXF3Q9H4D5 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NXF3Q9H4D5 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NXF3Q9H4D5 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
NXF3Q9H4D5 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NXF3Q9H4D5 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NXF3Q9H4D5 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NXF3Q9H4D5 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
NXF3Q9H4D5 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NXF3Q9H4D5 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NXF3Q9H4D5 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NXF3Q9H4D5 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NXF3Q9H4D5 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NXF3Q9H4D5 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NXF3Q9H4D5 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NXF3Q9H4D5 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NXF3Q9H4D5 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NXF3Q9H4D5 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NXF3Q9H4D5 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NXF3Q9H4D5 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NXF3Q9H4D5 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NXF3Q9H4D5 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NXF3Q9H4D5 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NXF3Q9H4D5 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NXF3Q9H4D5 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NXF3Q9H4D5 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
NXF3Q9H4D5 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
NXF3Q9H4D5 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
NXF3Q9H4D5 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NXF3Q9H4D5 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NXF3Q9H4D5 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
NXF3Q9H4D5 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NXF3Q9H4D5 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NXF3Q9H4D5 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NXF3Q9H4D5 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NXF3Q9H4D5 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NXF3Q9H4D5 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NXF3Q9H4D5 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NXF3Q9H4D5 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NXF3Q9H4D5 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NXF3Q9H4D5 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NXF3Q9H4D5 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NXF3Q9H4D5 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NXF3Q9H4D5 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
NXF3Q9H4D5 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NXF3Q9H4D5 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NXF3Q9H4D5 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NXF3Q9H4D5 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NXF3Q9H4D5 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NXF3Q9H4D5 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NXF3Q9H4D5 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
NXF3Q9H4D5 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NXF3Q9H4D5 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NXF3Q9H4D5 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
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