Protein–RNA interactions for Protein: Q9H444

CHMP4B, Charged multivesicular body protein 4b, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4BQ9H444 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHMP4BQ9H444 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHMP4BQ9H444 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHMP4BQ9H444 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP4BQ9H444 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP4BQ9H444 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP4BQ9H444 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP4BQ9H444 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP4BQ9H444 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP4BQ9H444 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP4BQ9H444 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP4BQ9H444 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP4BQ9H444 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP4BQ9H444 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP4BQ9H444 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP4BQ9H444 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP4BQ9H444 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP4BQ9H444 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP4BQ9H444 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP4BQ9H444 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP4BQ9H444 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP4BQ9H444 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP4BQ9H444 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP4BQ9H444 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP4BQ9H444 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP4BQ9H444 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP4BQ9H444 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP4BQ9H444 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP4BQ9H444 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP4BQ9H444 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP4BQ9H444 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP4BQ9H444 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP4BQ9H444 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP4BQ9H444 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHMP4BQ9H444 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHMP4BQ9H444 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHMP4BQ9H444 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHMP4BQ9H444 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHMP4BQ9H444 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHMP4BQ9H444 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHMP4BQ9H444 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHMP4BQ9H444 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHMP4BQ9H444 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHMP4BQ9H444 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CHMP4BQ9H444 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHMP4BQ9H444 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHMP4BQ9H444 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHMP4BQ9H444 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CHMP4BQ9H444 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CHMP4BQ9H444 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CHMP4BQ9H444 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHMP4BQ9H444 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHMP4BQ9H444 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CHMP4BQ9H444 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHMP4BQ9H444 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHMP4BQ9H444 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHMP4BQ9H444 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CHMP4BQ9H444 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHMP4BQ9H444 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHMP4BQ9H444 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHMP4BQ9H444 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHMP4BQ9H444 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHMP4BQ9H444 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMP4BQ9H444 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMP4BQ9H444 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMP4BQ9H444 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMP4BQ9H444 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMP4BQ9H444 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMP4BQ9H444 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMP4BQ9H444 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMP4BQ9H444 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMP4BQ9H444 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMP4BQ9H444 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMP4BQ9H444 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMP4BQ9H444 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMP4BQ9H444 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMP4BQ9H444 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMP4BQ9H444 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMP4BQ9H444 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMP4BQ9H444 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMP4BQ9H444 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMP4BQ9H444 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMP4BQ9H444 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMP4BQ9H444 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMP4BQ9H444 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMP4BQ9H444 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMP4BQ9H444 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHMP4BQ9H444 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHMP4BQ9H444 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHMP4BQ9H444 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHMP4BQ9H444 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHMP4BQ9H444 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHMP4BQ9H444 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHMP4BQ9H444 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHMP4BQ9H444 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CHMP4BQ9H444 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHMP4BQ9H444 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHMP4BQ9H444 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHMP4BQ9H444 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHMP4BQ9H444 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms