Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms