Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZI7

UPF3B, Regulator of nonsense transcripts 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF3BQ9BZI7 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UPF3BQ9BZI7 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UPF3BQ9BZI7 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UPF3BQ9BZI7 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UPF3BQ9BZI7 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UPF3BQ9BZI7 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UPF3BQ9BZI7 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UPF3BQ9BZI7 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UPF3BQ9BZI7 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UPF3BQ9BZI7 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UPF3BQ9BZI7 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UPF3BQ9BZI7 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UPF3BQ9BZI7 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UPF3BQ9BZI7 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
UPF3BQ9BZI7 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UPF3BQ9BZI7 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UPF3BQ9BZI7 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UPF3BQ9BZI7 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UPF3BQ9BZI7 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UPF3BQ9BZI7 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UPF3BQ9BZI7 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UPF3BQ9BZI7 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UPF3BQ9BZI7 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UPF3BQ9BZI7 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UPF3BQ9BZI7 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UPF3BQ9BZI7 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UPF3BQ9BZI7 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UPF3BQ9BZI7 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UPF3BQ9BZI7 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UPF3BQ9BZI7 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UPF3BQ9BZI7 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UPF3BQ9BZI7 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UPF3BQ9BZI7 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UPF3BQ9BZI7 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UPF3BQ9BZI7 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UPF3BQ9BZI7 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
UPF3BQ9BZI7 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
UPF3BQ9BZI7 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UPF3BQ9BZI7 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UPF3BQ9BZI7 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UPF3BQ9BZI7 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UPF3BQ9BZI7 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UPF3BQ9BZI7 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UPF3BQ9BZI7 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UPF3BQ9BZI7 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UPF3BQ9BZI7 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UPF3BQ9BZI7 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
UPF3BQ9BZI7 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UPF3BQ9BZI7 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UPF3BQ9BZI7 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UPF3BQ9BZI7 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UPF3BQ9BZI7 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UPF3BQ9BZI7 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UPF3BQ9BZI7 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UPF3BQ9BZI7 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
UPF3BQ9BZI7 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UPF3BQ9BZI7 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UPF3BQ9BZI7 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
UPF3BQ9BZI7 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UPF3BQ9BZI7 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UPF3BQ9BZI7 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UPF3BQ9BZI7 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
UPF3BQ9BZI7 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UPF3BQ9BZI7 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UPF3BQ9BZI7 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UPF3BQ9BZI7 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UPF3BQ9BZI7 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UPF3BQ9BZI7 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UPF3BQ9BZI7 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UPF3BQ9BZI7 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UPF3BQ9BZI7 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UPF3BQ9BZI7 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UPF3BQ9BZI7 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UPF3BQ9BZI7 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UPF3BQ9BZI7 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UPF3BQ9BZI7 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UPF3BQ9BZI7 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UPF3BQ9BZI7 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UPF3BQ9BZI7 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UPF3BQ9BZI7 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UPF3BQ9BZI7 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UPF3BQ9BZI7 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UPF3BQ9BZI7 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
UPF3BQ9BZI7 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UPF3BQ9BZI7 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UPF3BQ9BZI7 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UPF3BQ9BZI7 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UPF3BQ9BZI7 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UPF3BQ9BZI7 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UPF3BQ9BZI7 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
UPF3BQ9BZI7 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UPF3BQ9BZI7 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UPF3BQ9BZI7 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UPF3BQ9BZI7 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
UPF3BQ9BZI7 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UPF3BQ9BZI7 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UPF3BQ9BZI7 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UPF3BQ9BZI7 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UPF3BQ9BZI7 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UPF3BQ9BZI7 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms