Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE3

BARHL1, BarH-like 1 homeobox protein, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARHL1Q9BZE3 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BARHL1Q9BZE3 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BARHL1Q9BZE3 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BARHL1Q9BZE3 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
BARHL1Q9BZE3 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BARHL1Q9BZE3 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BARHL1Q9BZE3 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BARHL1Q9BZE3 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
BARHL1Q9BZE3 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BARHL1Q9BZE3 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BARHL1Q9BZE3 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
BARHL1Q9BZE3 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
BARHL1Q9BZE3 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
BARHL1Q9BZE3 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BARHL1Q9BZE3 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BARHL1Q9BZE3 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BARHL1Q9BZE3 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BARHL1Q9BZE3 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BARHL1Q9BZE3 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BARHL1Q9BZE3 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BARHL1Q9BZE3 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BARHL1Q9BZE3 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BARHL1Q9BZE3 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BARHL1Q9BZE3 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BARHL1Q9BZE3 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BARHL1Q9BZE3 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BARHL1Q9BZE3 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BARHL1Q9BZE3 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BARHL1Q9BZE3 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BARHL1Q9BZE3 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BARHL1Q9BZE3 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BARHL1Q9BZE3 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BARHL1Q9BZE3 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BARHL1Q9BZE3 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BARHL1Q9BZE3 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BARHL1Q9BZE3 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BARHL1Q9BZE3 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BARHL1Q9BZE3 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BARHL1Q9BZE3 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BARHL1Q9BZE3 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BARHL1Q9BZE3 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
BARHL1Q9BZE3 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BARHL1Q9BZE3 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BARHL1Q9BZE3 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BARHL1Q9BZE3 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BARHL1Q9BZE3 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BARHL1Q9BZE3 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BARHL1Q9BZE3 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BARHL1Q9BZE3 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BARHL1Q9BZE3 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BARHL1Q9BZE3 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
BARHL1Q9BZE3 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BARHL1Q9BZE3 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BARHL1Q9BZE3 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BARHL1Q9BZE3 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BARHL1Q9BZE3 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BARHL1Q9BZE3 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BARHL1Q9BZE3 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
BARHL1Q9BZE3 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
BARHL1Q9BZE3 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BARHL1Q9BZE3 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BARHL1Q9BZE3 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BARHL1Q9BZE3 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BARHL1Q9BZE3 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BARHL1Q9BZE3 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BARHL1Q9BZE3 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BARHL1Q9BZE3 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BARHL1Q9BZE3 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BARHL1Q9BZE3 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BARHL1Q9BZE3 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BARHL1Q9BZE3 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BARHL1Q9BZE3 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BARHL1Q9BZE3 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BARHL1Q9BZE3 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BARHL1Q9BZE3 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BARHL1Q9BZE3 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BARHL1Q9BZE3 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BARHL1Q9BZE3 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BARHL1Q9BZE3 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BARHL1Q9BZE3 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BARHL1Q9BZE3 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BARHL1Q9BZE3 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BARHL1Q9BZE3 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
BARHL1Q9BZE3 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BARHL1Q9BZE3 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BARHL1Q9BZE3 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BARHL1Q9BZE3 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BARHL1Q9BZE3 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BARHL1Q9BZE3 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BARHL1Q9BZE3 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BARHL1Q9BZE3 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BARHL1Q9BZE3 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BARHL1Q9BZE3 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BARHL1Q9BZE3 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BARHL1Q9BZE3 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BARHL1Q9BZE3 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BARHL1Q9BZE3 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BARHL1Q9BZE3 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BARHL1Q9BZE3 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BARHL1Q9BZE3 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms