Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWE0

REPIN1, Replication initiator 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REPIN1Q9BWE0 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
REPIN1Q9BWE0 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
REPIN1Q9BWE0 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
REPIN1Q9BWE0 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
REPIN1Q9BWE0 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
REPIN1Q9BWE0 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
REPIN1Q9BWE0 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
REPIN1Q9BWE0 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
REPIN1Q9BWE0 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
REPIN1Q9BWE0 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
REPIN1Q9BWE0 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
REPIN1Q9BWE0 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
REPIN1Q9BWE0 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
REPIN1Q9BWE0 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
REPIN1Q9BWE0 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
REPIN1Q9BWE0 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
REPIN1Q9BWE0 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
REPIN1Q9BWE0 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
REPIN1Q9BWE0 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
REPIN1Q9BWE0 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
REPIN1Q9BWE0 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
REPIN1Q9BWE0 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
REPIN1Q9BWE0 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
REPIN1Q9BWE0 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
REPIN1Q9BWE0 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
REPIN1Q9BWE0 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
REPIN1Q9BWE0 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
REPIN1Q9BWE0 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
REPIN1Q9BWE0 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
REPIN1Q9BWE0 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
REPIN1Q9BWE0 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
REPIN1Q9BWE0 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
REPIN1Q9BWE0 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
REPIN1Q9BWE0 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
REPIN1Q9BWE0 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
REPIN1Q9BWE0 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
REPIN1Q9BWE0 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
REPIN1Q9BWE0 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
REPIN1Q9BWE0 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
REPIN1Q9BWE0 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
REPIN1Q9BWE0 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
REPIN1Q9BWE0 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
REPIN1Q9BWE0 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
REPIN1Q9BWE0 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
REPIN1Q9BWE0 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
REPIN1Q9BWE0 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
REPIN1Q9BWE0 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
REPIN1Q9BWE0 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
REPIN1Q9BWE0 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
REPIN1Q9BWE0 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
REPIN1Q9BWE0 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
REPIN1Q9BWE0 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
REPIN1Q9BWE0 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
REPIN1Q9BWE0 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
REPIN1Q9BWE0 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
REPIN1Q9BWE0 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
REPIN1Q9BWE0 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
REPIN1Q9BWE0 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
REPIN1Q9BWE0 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
REPIN1Q9BWE0 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
REPIN1Q9BWE0 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
REPIN1Q9BWE0 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
REPIN1Q9BWE0 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
REPIN1Q9BWE0 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
REPIN1Q9BWE0 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
REPIN1Q9BWE0 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
REPIN1Q9BWE0 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
REPIN1Q9BWE0 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
REPIN1Q9BWE0 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
REPIN1Q9BWE0 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
REPIN1Q9BWE0 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
REPIN1Q9BWE0 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
REPIN1Q9BWE0 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
REPIN1Q9BWE0 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
REPIN1Q9BWE0 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
REPIN1Q9BWE0 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
REPIN1Q9BWE0 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
REPIN1Q9BWE0 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
REPIN1Q9BWE0 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
REPIN1Q9BWE0 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
REPIN1Q9BWE0 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
REPIN1Q9BWE0 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
REPIN1Q9BWE0 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
REPIN1Q9BWE0 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
REPIN1Q9BWE0 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
REPIN1Q9BWE0 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
REPIN1Q9BWE0 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
REPIN1Q9BWE0 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
REPIN1Q9BWE0 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
REPIN1Q9BWE0 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
REPIN1Q9BWE0 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
REPIN1Q9BWE0 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
REPIN1Q9BWE0 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
REPIN1Q9BWE0 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
REPIN1Q9BWE0 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
REPIN1Q9BWE0 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
REPIN1Q9BWE0 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
REPIN1Q9BWE0 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
REPIN1Q9BWE0 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
REPIN1Q9BWE0 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms