Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG4

PBDC1, Protein PBDC1, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBDC1Q9BVG4 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PBDC1Q9BVG4 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PBDC1Q9BVG4 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms