Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUK0

CHCHD7, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD7Q9BUK0 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
CHCHD7Q9BUK0 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CHCHD7Q9BUK0 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CHCHD7Q9BUK0 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CHCHD7Q9BUK0 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CHCHD7Q9BUK0 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CHCHD7Q9BUK0 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CHCHD7Q9BUK0 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CHCHD7Q9BUK0 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CHCHD7Q9BUK0 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CHCHD7Q9BUK0 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CHCHD7Q9BUK0 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CHCHD7Q9BUK0 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CHCHD7Q9BUK0 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CHCHD7Q9BUK0 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CHCHD7Q9BUK0 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CHCHD7Q9BUK0 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CHCHD7Q9BUK0 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CHCHD7Q9BUK0 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CHCHD7Q9BUK0 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
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