Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSM1

PCGF1, Polycomb group RING finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF1Q9BSM1 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PCGF1Q9BSM1 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms