Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH5

HDHD3, Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDHD3Q9BSH5 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HDHD3Q9BSH5 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
HDHD3Q9BSH5 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HDHD3Q9BSH5 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
HDHD3Q9BSH5 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HDHD3Q9BSH5 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HDHD3Q9BSH5 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms