Protein–RNA interactions for Protein: Q99836

MYD88, Myeloid differentiation primary response protein MyD88, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYD88Q99836 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MYD88Q99836 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MYD88Q99836 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MYD88Q99836 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MYD88Q99836 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MYD88Q99836 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MYD88Q99836 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MYD88Q99836 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MYD88Q99836 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MYD88Q99836 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MYD88Q99836 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MYD88Q99836 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MYD88Q99836 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
MYD88Q99836 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MYD88Q99836 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MYD88Q99836 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MYD88Q99836 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MYD88Q99836 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
MYD88Q99836 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MYD88Q99836 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MYD88Q99836 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MYD88Q99836 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MYD88Q99836 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MYD88Q99836 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MYD88Q99836 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MYD88Q99836 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MYD88Q99836 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MYD88Q99836 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MYD88Q99836 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MYD88Q99836 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MYD88Q99836 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MYD88Q99836 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MYD88Q99836 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MYD88Q99836 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MYD88Q99836 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MYD88Q99836 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MYD88Q99836 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MYD88Q99836 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MYD88Q99836 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MYD88Q99836 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MYD88Q99836 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MYD88Q99836 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MYD88Q99836 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MYD88Q99836 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MYD88Q99836 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MYD88Q99836 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MYD88Q99836 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MYD88Q99836 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MYD88Q99836 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MYD88Q99836 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MYD88Q99836 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MYD88Q99836 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MYD88Q99836 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MYD88Q99836 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MYD88Q99836 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MYD88Q99836 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MYD88Q99836 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MYD88Q99836 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MYD88Q99836 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MYD88Q99836 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MYD88Q99836 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
MYD88Q99836 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
MYD88Q99836 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MYD88Q99836 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
MYD88Q99836 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
MYD88Q99836 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MYD88Q99836 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MYD88Q99836 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MYD88Q99836 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MYD88Q99836 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MYD88Q99836 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MYD88Q99836 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MYD88Q99836 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MYD88Q99836 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MYD88Q99836 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MYD88Q99836 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MYD88Q99836 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MYD88Q99836 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MYD88Q99836 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MYD88Q99836 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MYD88Q99836 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MYD88Q99836 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MYD88Q99836 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MYD88Q99836 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MYD88Q99836 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MYD88Q99836 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MYD88Q99836 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MYD88Q99836 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MYD88Q99836 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MYD88Q99836 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MYD88Q99836 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MYD88Q99836 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MYD88Q99836 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MYD88Q99836 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MYD88Q99836 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MYD88Q99836 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MYD88Q99836 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MYD88Q99836 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MYD88Q99836 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MYD88Q99836 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms