Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RBBP8Q99708 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms