Protein–RNA interactions for Protein: Q99471

PFDN5, Prefoldin subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN5Q99471 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PFDN5Q99471 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PFDN5Q99471 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PFDN5Q99471 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PFDN5Q99471 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PFDN5Q99471 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PFDN5Q99471 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PFDN5Q99471 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PFDN5Q99471 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PFDN5Q99471 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PFDN5Q99471 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PFDN5Q99471 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PFDN5Q99471 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PFDN5Q99471 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PFDN5Q99471 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PFDN5Q99471 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PFDN5Q99471 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PFDN5Q99471 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PFDN5Q99471 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PFDN5Q99471 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PFDN5Q99471 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
PFDN5Q99471 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PFDN5Q99471 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PFDN5Q99471 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PFDN5Q99471 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PFDN5Q99471 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PFDN5Q99471 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PFDN5Q99471 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PFDN5Q99471 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PFDN5Q99471 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PFDN5Q99471 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PFDN5Q99471 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PFDN5Q99471 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PFDN5Q99471 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PFDN5Q99471 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PFDN5Q99471 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PFDN5Q99471 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PFDN5Q99471 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PFDN5Q99471 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PFDN5Q99471 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PFDN5Q99471 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PFDN5Q99471 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PFDN5Q99471 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PFDN5Q99471 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PFDN5Q99471 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PFDN5Q99471 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PFDN5Q99471 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PFDN5Q99471 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PFDN5Q99471 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PFDN5Q99471 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PFDN5Q99471 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PFDN5Q99471 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PFDN5Q99471 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PFDN5Q99471 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PFDN5Q99471 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PFDN5Q99471 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PFDN5Q99471 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PFDN5Q99471 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PFDN5Q99471 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PFDN5Q99471 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
PFDN5Q99471 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PFDN5Q99471 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PFDN5Q99471 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PFDN5Q99471 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PFDN5Q99471 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PFDN5Q99471 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PFDN5Q99471 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PFDN5Q99471 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PFDN5Q99471 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PFDN5Q99471 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PFDN5Q99471 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PFDN5Q99471 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PFDN5Q99471 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PFDN5Q99471 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PFDN5Q99471 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PFDN5Q99471 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PFDN5Q99471 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
PFDN5Q99471 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PFDN5Q99471 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PFDN5Q99471 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PFDN5Q99471 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PFDN5Q99471 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PFDN5Q99471 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PFDN5Q99471 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PFDN5Q99471 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PFDN5Q99471 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PFDN5Q99471 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PFDN5Q99471 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PFDN5Q99471 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PFDN5Q99471 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PFDN5Q99471 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PFDN5Q99471 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
PFDN5Q99471 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
PFDN5Q99471 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PFDN5Q99471 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PFDN5Q99471 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PFDN5Q99471 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PFDN5Q99471 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PFDN5Q99471 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PFDN5Q99471 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms