Protein–RNA interactions for Protein: Q99081

TCF12, Transcription factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 682 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF12Q99081 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TCF12Q99081 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms