Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q35

ALS2CR12, Amyotrophic lateral sclerosis 2 chromosomal region candidate gene 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CR12Q96Q35 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ALS2CR12Q96Q35 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ALS2CR12Q96Q35 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms