Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAPPC9Q96Q05 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRAPPC9Q96Q05 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms