Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q04

LMTK3, Serine/threonine-protein kinase LMTK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMTK3Q96Q04 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LMTK3Q96Q04 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LMTK3Q96Q04 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
LMTK3Q96Q04 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LMTK3Q96Q04 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LMTK3Q96Q04 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LMTK3Q96Q04 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LMTK3Q96Q04 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LMTK3Q96Q04 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LMTK3Q96Q04 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LMTK3Q96Q04 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LMTK3Q96Q04 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LMTK3Q96Q04 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LMTK3Q96Q04 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
LMTK3Q96Q04 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LMTK3Q96Q04 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LMTK3Q96Q04 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
LMTK3Q96Q04 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LMTK3Q96Q04 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LMTK3Q96Q04 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LMTK3Q96Q04 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LMTK3Q96Q04 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LMTK3Q96Q04 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LMTK3Q96Q04 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LMTK3Q96Q04 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LMTK3Q96Q04 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LMTK3Q96Q04 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
LMTK3Q96Q04 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
LMTK3Q96Q04 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LMTK3Q96Q04 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
LMTK3Q96Q04 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LMTK3Q96Q04 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LMTK3Q96Q04 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LMTK3Q96Q04 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LMTK3Q96Q04 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LMTK3Q96Q04 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LMTK3Q96Q04 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LMTK3Q96Q04 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LMTK3Q96Q04 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LMTK3Q96Q04 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LMTK3Q96Q04 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LMTK3Q96Q04 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LMTK3Q96Q04 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LMTK3Q96Q04 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LMTK3Q96Q04 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LMTK3Q96Q04 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LMTK3Q96Q04 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LMTK3Q96Q04 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LMTK3Q96Q04 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LMTK3Q96Q04 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LMTK3Q96Q04 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
LMTK3Q96Q04 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LMTK3Q96Q04 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LMTK3Q96Q04 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LMTK3Q96Q04 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LMTK3Q96Q04 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LMTK3Q96Q04 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LMTK3Q96Q04 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LMTK3Q96Q04 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LMTK3Q96Q04 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
LMTK3Q96Q04 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LMTK3Q96Q04 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
LMTK3Q96Q04 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LMTK3Q96Q04 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LMTK3Q96Q04 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LMTK3Q96Q04 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LMTK3Q96Q04 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LMTK3Q96Q04 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LMTK3Q96Q04 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LMTK3Q96Q04 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LMTK3Q96Q04 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LMTK3Q96Q04 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LMTK3Q96Q04 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LMTK3Q96Q04 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LMTK3Q96Q04 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LMTK3Q96Q04 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LMTK3Q96Q04 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LMTK3Q96Q04 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LMTK3Q96Q04 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LMTK3Q96Q04 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LMTK3Q96Q04 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LMTK3Q96Q04 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.84
LMTK3Q96Q04 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
LMTK3Q96Q04 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LMTK3Q96Q04 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LMTK3Q96Q04 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LMTK3Q96Q04 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LMTK3Q96Q04 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LMTK3Q96Q04 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LMTK3Q96Q04 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LMTK3Q96Q04 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
LMTK3Q96Q04 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LMTK3Q96Q04 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LMTK3Q96Q04 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LMTK3Q96Q04 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LMTK3Q96Q04 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LMTK3Q96Q04 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LMTK3Q96Q04 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LMTK3Q96Q04 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LMTK3Q96Q04 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms