Protein–RNA interactions for Protein: Q96NW7

LRRC7, Leucine-rich repeat-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC7Q96NW7 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRC7Q96NW7 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRC7Q96NW7 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRC7Q96NW7 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRC7Q96NW7 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRC7Q96NW7 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRC7Q96NW7 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRC7Q96NW7 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRC7Q96NW7 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRC7Q96NW7 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRC7Q96NW7 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRC7Q96NW7 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRC7Q96NW7 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRC7Q96NW7 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRC7Q96NW7 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRC7Q96NW7 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRC7Q96NW7 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRC7Q96NW7 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRC7Q96NW7 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRC7Q96NW7 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRC7Q96NW7 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRC7Q96NW7 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRC7Q96NW7 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRC7Q96NW7 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRC7Q96NW7 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRC7Q96NW7 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRC7Q96NW7 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC7Q96NW7 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC7Q96NW7 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC7Q96NW7 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC7Q96NW7 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC7Q96NW7 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC7Q96NW7 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC7Q96NW7 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC7Q96NW7 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC7Q96NW7 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC7Q96NW7 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC7Q96NW7 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC7Q96NW7 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC7Q96NW7 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC7Q96NW7 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC7Q96NW7 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC7Q96NW7 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC7Q96NW7 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC7Q96NW7 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC7Q96NW7 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC7Q96NW7 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC7Q96NW7 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC7Q96NW7 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC7Q96NW7 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC7Q96NW7 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC7Q96NW7 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRC7Q96NW7 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRC7Q96NW7 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRC7Q96NW7 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRC7Q96NW7 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRC7Q96NW7 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRC7Q96NW7 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRC7Q96NW7 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRC7Q96NW7 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRC7Q96NW7 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRC7Q96NW7 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRC7Q96NW7 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRC7Q96NW7 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRC7Q96NW7 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRC7Q96NW7 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRC7Q96NW7 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRC7Q96NW7 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRC7Q96NW7 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LRRC7Q96NW7 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LRRC7Q96NW7 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
LRRC7Q96NW7 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
LRRC7Q96NW7 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
LRRC7Q96NW7 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
LRRC7Q96NW7 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
LRRC7Q96NW7 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LRRC7Q96NW7 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
LRRC7Q96NW7 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LRRC7Q96NW7 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC26■■□□□ 1.75
LRRC7Q96NW7 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
LRRC7Q96NW7 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRC7Q96NW7 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRC7Q96NW7 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRC7Q96NW7 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRC7Q96NW7 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRC7Q96NW7 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRC7Q96NW7 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRC7Q96NW7 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRC7Q96NW7 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRC7Q96NW7 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRC7Q96NW7 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRC7Q96NW7 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRC7Q96NW7 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRC7Q96NW7 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRC7Q96NW7 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRC7Q96NW7 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRC7Q96NW7 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRC7Q96NW7 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRC7Q96NW7 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRC7Q96NW7 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms