Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA8

TSNARE1, t-SNARE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1Q96NA8 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TSNARE1Q96NA8 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms