Protein–RNA interactions for Protein: Q96M91

CFAP53, Cilia- and flagella-associated protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP53Q96M91 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CFAP53Q96M91 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CFAP53Q96M91 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CFAP53Q96M91 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CFAP53Q96M91 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CFAP53Q96M91 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CFAP53Q96M91 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CFAP53Q96M91 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CFAP53Q96M91 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CFAP53Q96M91 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CFAP53Q96M91 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CFAP53Q96M91 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CFAP53Q96M91 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CFAP53Q96M91 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CFAP53Q96M91 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CFAP53Q96M91 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CFAP53Q96M91 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CFAP53Q96M91 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CFAP53Q96M91 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CFAP53Q96M91 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CFAP53Q96M91 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CFAP53Q96M91 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CFAP53Q96M91 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CFAP53Q96M91 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CFAP53Q96M91 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CFAP53Q96M91 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CFAP53Q96M91 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CFAP53Q96M91 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CFAP53Q96M91 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CFAP53Q96M91 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CFAP53Q96M91 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CFAP53Q96M91 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CFAP53Q96M91 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CFAP53Q96M91 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CFAP53Q96M91 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CFAP53Q96M91 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CFAP53Q96M91 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CFAP53Q96M91 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CFAP53Q96M91 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CFAP53Q96M91 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CFAP53Q96M91 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CFAP53Q96M91 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CFAP53Q96M91 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CFAP53Q96M91 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CFAP53Q96M91 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CFAP53Q96M91 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CFAP53Q96M91 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CFAP53Q96M91 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CFAP53Q96M91 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CFAP53Q96M91 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CFAP53Q96M91 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CFAP53Q96M91 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CFAP53Q96M91 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CFAP53Q96M91 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CFAP53Q96M91 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CFAP53Q96M91 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CFAP53Q96M91 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CFAP53Q96M91 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CFAP53Q96M91 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CFAP53Q96M91 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CFAP53Q96M91 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CFAP53Q96M91 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CFAP53Q96M91 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CFAP53Q96M91 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CFAP53Q96M91 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CFAP53Q96M91 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CFAP53Q96M91 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CFAP53Q96M91 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CFAP53Q96M91 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CFAP53Q96M91 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CFAP53Q96M91 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CFAP53Q96M91 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CFAP53Q96M91 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CFAP53Q96M91 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CFAP53Q96M91 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CFAP53Q96M91 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CFAP53Q96M91 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CFAP53Q96M91 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CFAP53Q96M91 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CFAP53Q96M91 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CFAP53Q96M91 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CFAP53Q96M91 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CFAP53Q96M91 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CFAP53Q96M91 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CFAP53Q96M91 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CFAP53Q96M91 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CFAP53Q96M91 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CFAP53Q96M91 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CFAP53Q96M91 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CFAP53Q96M91 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CFAP53Q96M91 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CFAP53Q96M91 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CFAP53Q96M91 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CFAP53Q96M91 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CFAP53Q96M91 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CFAP53Q96M91 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CFAP53Q96M91 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CFAP53Q96M91 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CFAP53Q96M91 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CFAP53Q96M91 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms