Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB3

HIC2, Hypermethylated in cancer 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIC2Q96JB3 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HIC2Q96JB3 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms