Protein–RNA interactions for Protein: Q96G01

BICD1, Protein bicaudal D homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BICD1Q96G01 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BICD1Q96G01 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BICD1Q96G01 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BICD1Q96G01 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BICD1Q96G01 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BICD1Q96G01 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BICD1Q96G01 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BICD1Q96G01 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BICD1Q96G01 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BICD1Q96G01 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BICD1Q96G01 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BICD1Q96G01 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BICD1Q96G01 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BICD1Q96G01 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BICD1Q96G01 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BICD1Q96G01 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BICD1Q96G01 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BICD1Q96G01 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BICD1Q96G01 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BICD1Q96G01 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BICD1Q96G01 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BICD1Q96G01 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BICD1Q96G01 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
BICD1Q96G01 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BICD1Q96G01 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BICD1Q96G01 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BICD1Q96G01 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BICD1Q96G01 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BICD1Q96G01 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BICD1Q96G01 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BICD1Q96G01 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BICD1Q96G01 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BICD1Q96G01 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BICD1Q96G01 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BICD1Q96G01 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BICD1Q96G01 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BICD1Q96G01 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BICD1Q96G01 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
BICD1Q96G01 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
BICD1Q96G01 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
BICD1Q96G01 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BICD1Q96G01 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BICD1Q96G01 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
BICD1Q96G01 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BICD1Q96G01 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
BICD1Q96G01 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
BICD1Q96G01 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BICD1Q96G01 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BICD1Q96G01 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BICD1Q96G01 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
BICD1Q96G01 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
BICD1Q96G01 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BICD1Q96G01 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BICD1Q96G01 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BICD1Q96G01 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BICD1Q96G01 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BICD1Q96G01 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BICD1Q96G01 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BICD1Q96G01 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BICD1Q96G01 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BICD1Q96G01 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BICD1Q96G01 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BICD1Q96G01 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BICD1Q96G01 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BICD1Q96G01 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BICD1Q96G01 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BICD1Q96G01 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BICD1Q96G01 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
BICD1Q96G01 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BICD1Q96G01 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BICD1Q96G01 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
BICD1Q96G01 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BICD1Q96G01 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BICD1Q96G01 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BICD1Q96G01 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BICD1Q96G01 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BICD1Q96G01 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
BICD1Q96G01 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BICD1Q96G01 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BICD1Q96G01 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BICD1Q96G01 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BICD1Q96G01 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BICD1Q96G01 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BICD1Q96G01 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BICD1Q96G01 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BICD1Q96G01 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BICD1Q96G01 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BICD1Q96G01 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BICD1Q96G01 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BICD1Q96G01 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BICD1Q96G01 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BICD1Q96G01 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BICD1Q96G01 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BICD1Q96G01 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BICD1Q96G01 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BICD1Q96G01 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BICD1Q96G01 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BICD1Q96G01 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BICD1Q96G01 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BICD1Q96G01 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms