Protein–RNA interactions for Protein: Q96DT6

ATG4C, Cysteine protease ATG4C, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4CQ96DT6 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ATG4CQ96DT6 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ATG4CQ96DT6 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATG4CQ96DT6 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATG4CQ96DT6 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATG4CQ96DT6 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATG4CQ96DT6 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ATG4CQ96DT6 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATG4CQ96DT6 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ATG4CQ96DT6 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ATG4CQ96DT6 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ATG4CQ96DT6 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ATG4CQ96DT6 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
ATG4CQ96DT6 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ATG4CQ96DT6 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ATG4CQ96DT6 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATG4CQ96DT6 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ATG4CQ96DT6 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ATG4CQ96DT6 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ATG4CQ96DT6 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ATG4CQ96DT6 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATG4CQ96DT6 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATG4CQ96DT6 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATG4CQ96DT6 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ATG4CQ96DT6 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATG4CQ96DT6 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATG4CQ96DT6 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATG4CQ96DT6 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATG4CQ96DT6 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATG4CQ96DT6 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATG4CQ96DT6 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATG4CQ96DT6 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATG4CQ96DT6 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ATG4CQ96DT6 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATG4CQ96DT6 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATG4CQ96DT6 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATG4CQ96DT6 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ATG4CQ96DT6 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ATG4CQ96DT6 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ATG4CQ96DT6 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ATG4CQ96DT6 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ATG4CQ96DT6 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ATG4CQ96DT6 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATG4CQ96DT6 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ATG4CQ96DT6 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
ATG4CQ96DT6 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATG4CQ96DT6 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ATG4CQ96DT6 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATG4CQ96DT6 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATG4CQ96DT6 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATG4CQ96DT6 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATG4CQ96DT6 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATG4CQ96DT6 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATG4CQ96DT6 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATG4CQ96DT6 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATG4CQ96DT6 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
ATG4CQ96DT6 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ATG4CQ96DT6 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATG4CQ96DT6 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATG4CQ96DT6 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ATG4CQ96DT6 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
ATG4CQ96DT6 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ATG4CQ96DT6 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ATG4CQ96DT6 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATG4CQ96DT6 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ATG4CQ96DT6 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATG4CQ96DT6 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ATG4CQ96DT6 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATG4CQ96DT6 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ATG4CQ96DT6 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATG4CQ96DT6 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATG4CQ96DT6 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ATG4CQ96DT6 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ATG4CQ96DT6 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ATG4CQ96DT6 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ATG4CQ96DT6 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ATG4CQ96DT6 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ATG4CQ96DT6 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ATG4CQ96DT6 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATG4CQ96DT6 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ATG4CQ96DT6 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ATG4CQ96DT6 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ATG4CQ96DT6 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATG4CQ96DT6 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATG4CQ96DT6 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ATG4CQ96DT6 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ATG4CQ96DT6 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ATG4CQ96DT6 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ATG4CQ96DT6 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ATG4CQ96DT6 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ATG4CQ96DT6 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ATG4CQ96DT6 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG4CQ96DT6 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG4CQ96DT6 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG4CQ96DT6 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG4CQ96DT6 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG4CQ96DT6 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG4CQ96DT6 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG4CQ96DT6 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG4CQ96DT6 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms