Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM1

PGBD4, PiggyBac transposable element-derived protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD4Q96DM1 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PGBD4Q96DM1 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PGBD4Q96DM1 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PGBD4Q96DM1 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PGBD4Q96DM1 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PGBD4Q96DM1 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PGBD4Q96DM1 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PGBD4Q96DM1 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PGBD4Q96DM1 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PGBD4Q96DM1 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PGBD4Q96DM1 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PGBD4Q96DM1 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PGBD4Q96DM1 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PGBD4Q96DM1 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PGBD4Q96DM1 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PGBD4Q96DM1 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PGBD4Q96DM1 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PGBD4Q96DM1 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PGBD4Q96DM1 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PGBD4Q96DM1 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PGBD4Q96DM1 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PGBD4Q96DM1 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PGBD4Q96DM1 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PGBD4Q96DM1 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PGBD4Q96DM1 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PGBD4Q96DM1 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PGBD4Q96DM1 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PGBD4Q96DM1 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PGBD4Q96DM1 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PGBD4Q96DM1 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PGBD4Q96DM1 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PGBD4Q96DM1 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PGBD4Q96DM1 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PGBD4Q96DM1 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PGBD4Q96DM1 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PGBD4Q96DM1 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PGBD4Q96DM1 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PGBD4Q96DM1 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PGBD4Q96DM1 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PGBD4Q96DM1 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PGBD4Q96DM1 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PGBD4Q96DM1 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PGBD4Q96DM1 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PGBD4Q96DM1 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PGBD4Q96DM1 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PGBD4Q96DM1 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PGBD4Q96DM1 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PGBD4Q96DM1 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PGBD4Q96DM1 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PGBD4Q96DM1 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PGBD4Q96DM1 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PGBD4Q96DM1 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PGBD4Q96DM1 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PGBD4Q96DM1 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PGBD4Q96DM1 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PGBD4Q96DM1 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PGBD4Q96DM1 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PGBD4Q96DM1 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PGBD4Q96DM1 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PGBD4Q96DM1 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PGBD4Q96DM1 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PGBD4Q96DM1 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PGBD4Q96DM1 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PGBD4Q96DM1 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PGBD4Q96DM1 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PGBD4Q96DM1 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PGBD4Q96DM1 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PGBD4Q96DM1 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PGBD4Q96DM1 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PGBD4Q96DM1 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PGBD4Q96DM1 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PGBD4Q96DM1 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PGBD4Q96DM1 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PGBD4Q96DM1 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PGBD4Q96DM1 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PGBD4Q96DM1 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PGBD4Q96DM1 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PGBD4Q96DM1 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PGBD4Q96DM1 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PGBD4Q96DM1 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PGBD4Q96DM1 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PGBD4Q96DM1 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PGBD4Q96DM1 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PGBD4Q96DM1 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PGBD4Q96DM1 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PGBD4Q96DM1 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PGBD4Q96DM1 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PGBD4Q96DM1 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PGBD4Q96DM1 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PGBD4Q96DM1 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PGBD4Q96DM1 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PGBD4Q96DM1 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PGBD4Q96DM1 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PGBD4Q96DM1 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PGBD4Q96DM1 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PGBD4Q96DM1 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PGBD4Q96DM1 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PGBD4Q96DM1 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PGBD4Q96DM1 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PGBD4Q96DM1 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms