Protein–RNA interactions for Protein: Q96CE8

TM4SF18, Transmembrane 4 L6 family member 18, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF18Q96CE8 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TM4SF18Q96CE8 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TM4SF18Q96CE8 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TM4SF18Q96CE8 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TM4SF18Q96CE8 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TM4SF18Q96CE8 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TM4SF18Q96CE8 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TM4SF18Q96CE8 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TM4SF18Q96CE8 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TM4SF18Q96CE8 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TM4SF18Q96CE8 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TM4SF18Q96CE8 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TM4SF18Q96CE8 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TM4SF18Q96CE8 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TM4SF18Q96CE8 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TM4SF18Q96CE8 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TM4SF18Q96CE8 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TM4SF18Q96CE8 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TM4SF18Q96CE8 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TM4SF18Q96CE8 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TM4SF18Q96CE8 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TM4SF18Q96CE8 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TM4SF18Q96CE8 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TM4SF18Q96CE8 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TM4SF18Q96CE8 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TM4SF18Q96CE8 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TM4SF18Q96CE8 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TM4SF18Q96CE8 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TM4SF18Q96CE8 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TM4SF18Q96CE8 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TM4SF18Q96CE8 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TM4SF18Q96CE8 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TM4SF18Q96CE8 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TM4SF18Q96CE8 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TM4SF18Q96CE8 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TM4SF18Q96CE8 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TM4SF18Q96CE8 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TM4SF18Q96CE8 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TM4SF18Q96CE8 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TM4SF18Q96CE8 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TM4SF18Q96CE8 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TM4SF18Q96CE8 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TM4SF18Q96CE8 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TM4SF18Q96CE8 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TM4SF18Q96CE8 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TM4SF18Q96CE8 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TM4SF18Q96CE8 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TM4SF18Q96CE8 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TM4SF18Q96CE8 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TM4SF18Q96CE8 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TM4SF18Q96CE8 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TM4SF18Q96CE8 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TM4SF18Q96CE8 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TM4SF18Q96CE8 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TM4SF18Q96CE8 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TM4SF18Q96CE8 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TM4SF18Q96CE8 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TM4SF18Q96CE8 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TM4SF18Q96CE8 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TM4SF18Q96CE8 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TM4SF18Q96CE8 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TM4SF18Q96CE8 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TM4SF18Q96CE8 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TM4SF18Q96CE8 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
TM4SF18Q96CE8 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TM4SF18Q96CE8 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TM4SF18Q96CE8 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TM4SF18Q96CE8 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TM4SF18Q96CE8 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TM4SF18Q96CE8 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TM4SF18Q96CE8 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TM4SF18Q96CE8 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TM4SF18Q96CE8 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TM4SF18Q96CE8 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TM4SF18Q96CE8 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TM4SF18Q96CE8 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TM4SF18Q96CE8 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TM4SF18Q96CE8 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TM4SF18Q96CE8 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TM4SF18Q96CE8 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TM4SF18Q96CE8 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TM4SF18Q96CE8 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TM4SF18Q96CE8 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TM4SF18Q96CE8 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TM4SF18Q96CE8 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TM4SF18Q96CE8 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TM4SF18Q96CE8 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TM4SF18Q96CE8 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TM4SF18Q96CE8 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TM4SF18Q96CE8 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TM4SF18Q96CE8 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TM4SF18Q96CE8 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TM4SF18Q96CE8 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TM4SF18Q96CE8 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TM4SF18Q96CE8 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TM4SF18Q96CE8 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TM4SF18Q96CE8 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TM4SF18Q96CE8 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TM4SF18Q96CE8 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TM4SF18Q96CE8 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms