Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

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Length 353 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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TRIM63Q969Q1 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
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TRIM63Q969Q1 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TRIM63Q969Q1 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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