Protein–RNA interactions for Protein: Q92837

FRAT1, Proto-oncogene FRAT1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRAT1Q92837 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FRAT1Q92837 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FRAT1Q92837 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FRAT1Q92837 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FRAT1Q92837 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FRAT1Q92837 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FRAT1Q92837 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FRAT1Q92837 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FRAT1Q92837 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FRAT1Q92837 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FRAT1Q92837 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FRAT1Q92837 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FRAT1Q92837 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
FRAT1Q92837 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FRAT1Q92837 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FRAT1Q92837 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FRAT1Q92837 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FRAT1Q92837 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
FRAT1Q92837 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
FRAT1Q92837 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FRAT1Q92837 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FRAT1Q92837 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FRAT1Q92837 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FRAT1Q92837 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FRAT1Q92837 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FRAT1Q92837 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FRAT1Q92837 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FRAT1Q92837 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FRAT1Q92837 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
FRAT1Q92837 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FRAT1Q92837 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FRAT1Q92837 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FRAT1Q92837 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FRAT1Q92837 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FRAT1Q92837 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FRAT1Q92837 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FRAT1Q92837 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FRAT1Q92837 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FRAT1Q92837 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FRAT1Q92837 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FRAT1Q92837 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
FRAT1Q92837 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FRAT1Q92837 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FRAT1Q92837 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FRAT1Q92837 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FRAT1Q92837 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC24■■□□□ 1.43
FRAT1Q92837 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24■■□□□ 1.43
FRAT1Q92837 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FRAT1Q92837 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FRAT1Q92837 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC24■■□□□ 1.43
FRAT1Q92837 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FRAT1Q92837 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FRAT1Q92837 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FRAT1Q92837 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FRAT1Q92837 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FRAT1Q92837 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
FRAT1Q92837 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FRAT1Q92837 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FRAT1Q92837 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FRAT1Q92837 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FRAT1Q92837 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FRAT1Q92837 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FRAT1Q92837 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FRAT1Q92837 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FRAT1Q92837 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FRAT1Q92837 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FRAT1Q92837 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FRAT1Q92837 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
FRAT1Q92837 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FRAT1Q92837 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FRAT1Q92837 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FRAT1Q92837 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FRAT1Q92837 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FRAT1Q92837 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FRAT1Q92837 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FRAT1Q92837 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FRAT1Q92837 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FRAT1Q92837 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FRAT1Q92837 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FRAT1Q92837 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
FRAT1Q92837 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FRAT1Q92837 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FRAT1Q92837 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FRAT1Q92837 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FRAT1Q92837 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FRAT1Q92837 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FRAT1Q92837 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FRAT1Q92837 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FRAT1Q92837 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FRAT1Q92837 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FRAT1Q92837 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
FRAT1Q92837 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FRAT1Q92837 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FRAT1Q92837 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FRAT1Q92837 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FRAT1Q92837 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FRAT1Q92837 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FRAT1Q92837 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FRAT1Q92837 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FRAT1Q92837 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms