Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDG4

HELQ, Helicase POLQ-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELQQ8TDG4 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HELQQ8TDG4 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HELQQ8TDG4 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HELQQ8TDG4 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HELQQ8TDG4 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HELQQ8TDG4 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HELQQ8TDG4 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HELQQ8TDG4 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HELQQ8TDG4 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HELQQ8TDG4 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HELQQ8TDG4 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HELQQ8TDG4 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HELQQ8TDG4 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HELQQ8TDG4 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HELQQ8TDG4 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
HELQQ8TDG4 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HELQQ8TDG4 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
HELQQ8TDG4 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HELQQ8TDG4 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HELQQ8TDG4 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HELQQ8TDG4 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HELQQ8TDG4 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HELQQ8TDG4 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HELQQ8TDG4 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HELQQ8TDG4 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HELQQ8TDG4 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HELQQ8TDG4 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HELQQ8TDG4 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HELQQ8TDG4 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HELQQ8TDG4 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HELQQ8TDG4 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
HELQQ8TDG4 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HELQQ8TDG4 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HELQQ8TDG4 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HELQQ8TDG4 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HELQQ8TDG4 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HELQQ8TDG4 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HELQQ8TDG4 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HELQQ8TDG4 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HELQQ8TDG4 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
HELQQ8TDG4 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HELQQ8TDG4 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HELQQ8TDG4 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HELQQ8TDG4 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HELQQ8TDG4 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HELQQ8TDG4 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HELQQ8TDG4 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HELQQ8TDG4 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HELQQ8TDG4 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HELQQ8TDG4 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HELQQ8TDG4 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HELQQ8TDG4 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HELQQ8TDG4 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HELQQ8TDG4 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HELQQ8TDG4 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HELQQ8TDG4 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HELQQ8TDG4 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HELQQ8TDG4 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HELQQ8TDG4 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HELQQ8TDG4 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HELQQ8TDG4 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HELQQ8TDG4 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HELQQ8TDG4 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HELQQ8TDG4 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HELQQ8TDG4 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HELQQ8TDG4 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HELQQ8TDG4 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HELQQ8TDG4 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HELQQ8TDG4 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HELQQ8TDG4 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HELQQ8TDG4 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HELQQ8TDG4 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HELQQ8TDG4 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HELQQ8TDG4 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HELQQ8TDG4 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
HELQQ8TDG4 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HELQQ8TDG4 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HELQQ8TDG4 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HELQQ8TDG4 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HELQQ8TDG4 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HELQQ8TDG4 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HELQQ8TDG4 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HELQQ8TDG4 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HELQQ8TDG4 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HELQQ8TDG4 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HELQQ8TDG4 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HELQQ8TDG4 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HELQQ8TDG4 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HELQQ8TDG4 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HELQQ8TDG4 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HELQQ8TDG4 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HELQQ8TDG4 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HELQQ8TDG4 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HELQQ8TDG4 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HELQQ8TDG4 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HELQQ8TDG4 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HELQQ8TDG4 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HELQQ8TDG4 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HELQQ8TDG4 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
HELQQ8TDG4 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms