Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SEMA6DQ8NFY4 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA6DQ8NFY4 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA6DQ8NFY4 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA6DQ8NFY4 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA6DQ8NFY4 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA6DQ8NFY4 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA6DQ8NFY4 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA6DQ8NFY4 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA6DQ8NFY4 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA6DQ8NFY4 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA6DQ8NFY4 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA6DQ8NFY4 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA6DQ8NFY4 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA6DQ8NFY4 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA6DQ8NFY4 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA6DQ8NFY4 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA6DQ8NFY4 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA6DQ8NFY4 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA6DQ8NFY4 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA6DQ8NFY4 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA6DQ8NFY4 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA6DQ8NFY4 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA6DQ8NFY4 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA6DQ8NFY4 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA6DQ8NFY4 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA6DQ8NFY4 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA6DQ8NFY4 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA6DQ8NFY4 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA6DQ8NFY4 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA6DQ8NFY4 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA6DQ8NFY4 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA6DQ8NFY4 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA6DQ8NFY4 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA6DQ8NFY4 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA6DQ8NFY4 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA6DQ8NFY4 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA6DQ8NFY4 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA6DQ8NFY4 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SEMA6DQ8NFY4 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA6DQ8NFY4 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA6DQ8NFY4 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA6DQ8NFY4 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA6DQ8NFY4 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA6DQ8NFY4 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA6DQ8NFY4 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA6DQ8NFY4 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA6DQ8NFY4 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA6DQ8NFY4 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA6DQ8NFY4 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA6DQ8NFY4 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA6DQ8NFY4 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA6DQ8NFY4 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA6DQ8NFY4 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA6DQ8NFY4 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA6DQ8NFY4 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA6DQ8NFY4 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA6DQ8NFY4 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA6DQ8NFY4 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA6DQ8NFY4 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA6DQ8NFY4 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA6DQ8NFY4 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA6DQ8NFY4 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA6DQ8NFY4 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA6DQ8NFY4 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA6DQ8NFY4 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA6DQ8NFY4 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA6DQ8NFY4 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA6DQ8NFY4 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA6DQ8NFY4 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA6DQ8NFY4 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA6DQ8NFY4 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA6DQ8NFY4 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA6DQ8NFY4 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA6DQ8NFY4 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA6DQ8NFY4 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA6DQ8NFY4 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA6DQ8NFY4 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA6DQ8NFY4 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA6DQ8NFY4 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA6DQ8NFY4 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA6DQ8NFY4 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA6DQ8NFY4 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA6DQ8NFY4 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA6DQ8NFY4 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA6DQ8NFY4 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA6DQ8NFY4 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA6DQ8NFY4 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA6DQ8NFY4 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA6DQ8NFY4 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA6DQ8NFY4 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA6DQ8NFY4 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA6DQ8NFY4 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SEMA6DQ8NFY4 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SEMA6DQ8NFY4 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SEMA6DQ8NFY4 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SEMA6DQ8NFY4 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SEMA6DQ8NFY4 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SEMA6DQ8NFY4 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SEMA6DQ8NFY4 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms