Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU0

BEST4, Bestrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST4Q8NFU0 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
BEST4Q8NFU0 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BEST4Q8NFU0 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BEST4Q8NFU0 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BEST4Q8NFU0 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
BEST4Q8NFU0 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BEST4Q8NFU0 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BEST4Q8NFU0 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BEST4Q8NFU0 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BEST4Q8NFU0 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BEST4Q8NFU0 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BEST4Q8NFU0 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BEST4Q8NFU0 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BEST4Q8NFU0 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BEST4Q8NFU0 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
BEST4Q8NFU0 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
BEST4Q8NFU0 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BEST4Q8NFU0 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BEST4Q8NFU0 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BEST4Q8NFU0 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BEST4Q8NFU0 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BEST4Q8NFU0 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BEST4Q8NFU0 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BEST4Q8NFU0 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BEST4Q8NFU0 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BEST4Q8NFU0 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BEST4Q8NFU0 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BEST4Q8NFU0 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BEST4Q8NFU0 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BEST4Q8NFU0 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BEST4Q8NFU0 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BEST4Q8NFU0 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BEST4Q8NFU0 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BEST4Q8NFU0 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
BEST4Q8NFU0 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BEST4Q8NFU0 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BEST4Q8NFU0 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BEST4Q8NFU0 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BEST4Q8NFU0 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BEST4Q8NFU0 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BEST4Q8NFU0 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BEST4Q8NFU0 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BEST4Q8NFU0 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BEST4Q8NFU0 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BEST4Q8NFU0 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BEST4Q8NFU0 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BEST4Q8NFU0 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BEST4Q8NFU0 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BEST4Q8NFU0 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BEST4Q8NFU0 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BEST4Q8NFU0 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BEST4Q8NFU0 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BEST4Q8NFU0 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BEST4Q8NFU0 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BEST4Q8NFU0 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BEST4Q8NFU0 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
BEST4Q8NFU0 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BEST4Q8NFU0 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BEST4Q8NFU0 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BEST4Q8NFU0 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BEST4Q8NFU0 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BEST4Q8NFU0 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BEST4Q8NFU0 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BEST4Q8NFU0 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BEST4Q8NFU0 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BEST4Q8NFU0 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BEST4Q8NFU0 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BEST4Q8NFU0 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BEST4Q8NFU0 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BEST4Q8NFU0 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms