Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ZNF548Q8NEK5 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms