Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW8

TTC21A, Tetratricopeptide repeat protein 21A, humanhuman

Predictions only

Length 1,320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC21AQ8NDW8 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TTC21AQ8NDW8 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TTC21AQ8NDW8 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TTC21AQ8NDW8 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TTC21AQ8NDW8 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TTC21AQ8NDW8 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TTC21AQ8NDW8 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TTC21AQ8NDW8 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TTC21AQ8NDW8 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TTC21AQ8NDW8 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TTC21AQ8NDW8 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TTC21AQ8NDW8 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TTC21AQ8NDW8 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TTC21AQ8NDW8 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TTC21AQ8NDW8 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TTC21AQ8NDW8 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TTC21AQ8NDW8 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TTC21AQ8NDW8 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TTC21AQ8NDW8 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TTC21AQ8NDW8 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTC21AQ8NDW8 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTC21AQ8NDW8 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTC21AQ8NDW8 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTC21AQ8NDW8 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTC21AQ8NDW8 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTC21AQ8NDW8 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTC21AQ8NDW8 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTC21AQ8NDW8 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTC21AQ8NDW8 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTC21AQ8NDW8 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTC21AQ8NDW8 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTC21AQ8NDW8 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTC21AQ8NDW8 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTC21AQ8NDW8 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTC21AQ8NDW8 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTC21AQ8NDW8 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TTC21AQ8NDW8 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TTC21AQ8NDW8 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TTC21AQ8NDW8 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TTC21AQ8NDW8 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TTC21AQ8NDW8 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TTC21AQ8NDW8 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TTC21AQ8NDW8 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TTC21AQ8NDW8 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TTC21AQ8NDW8 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TTC21AQ8NDW8 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TTC21AQ8NDW8 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TTC21AQ8NDW8 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TTC21AQ8NDW8 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TTC21AQ8NDW8 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TTC21AQ8NDW8 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TTC21AQ8NDW8 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TTC21AQ8NDW8 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TTC21AQ8NDW8 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TTC21AQ8NDW8 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TTC21AQ8NDW8 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TTC21AQ8NDW8 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TTC21AQ8NDW8 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TTC21AQ8NDW8 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TTC21AQ8NDW8 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TTC21AQ8NDW8 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TTC21AQ8NDW8 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TTC21AQ8NDW8 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TTC21AQ8NDW8 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TTC21AQ8NDW8 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TTC21AQ8NDW8 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TTC21AQ8NDW8 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
TTC21AQ8NDW8 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TTC21AQ8NDW8 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TTC21AQ8NDW8 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TTC21AQ8NDW8 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TTC21AQ8NDW8 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TTC21AQ8NDW8 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TTC21AQ8NDW8 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TTC21AQ8NDW8 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TTC21AQ8NDW8 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TTC21AQ8NDW8 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TTC21AQ8NDW8 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TTC21AQ8NDW8 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TTC21AQ8NDW8 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TTC21AQ8NDW8 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TTC21AQ8NDW8 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TTC21AQ8NDW8 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TTC21AQ8NDW8 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TTC21AQ8NDW8 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TTC21AQ8NDW8 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TTC21AQ8NDW8 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TTC21AQ8NDW8 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TTC21AQ8NDW8 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TTC21AQ8NDW8 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TTC21AQ8NDW8 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TTC21AQ8NDW8 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TTC21AQ8NDW8 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TTC21AQ8NDW8 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TTC21AQ8NDW8 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTC21AQ8NDW8 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTC21AQ8NDW8 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTC21AQ8NDW8 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTC21AQ8NDW8 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTC21AQ8NDW8 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
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