Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDP4

ZNF439, Zinc finger protein 439, humanhuman

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF439Q8NDP4 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF439Q8NDP4 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF439Q8NDP4 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF439Q8NDP4 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF439Q8NDP4 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF439Q8NDP4 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF439Q8NDP4 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF439Q8NDP4 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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ZNF439Q8NDP4 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF439Q8NDP4 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF439Q8NDP4 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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ZNF439Q8NDP4 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF439Q8NDP4 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF439Q8NDP4 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF439Q8NDP4 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF439Q8NDP4 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF439Q8NDP4 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF439Q8NDP4 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF439Q8NDP4 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF439Q8NDP4 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF439Q8NDP4 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF439Q8NDP4 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF439Q8NDP4 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF439Q8NDP4 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF439Q8NDP4 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF439Q8NDP4 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF439Q8NDP4 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF439Q8NDP4 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF439Q8NDP4 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF439Q8NDP4 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF439Q8NDP4 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF439Q8NDP4 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF439Q8NDP4 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF439Q8NDP4 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF439Q8NDP4 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF439Q8NDP4 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF439Q8NDP4 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF439Q8NDP4 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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ZNF439Q8NDP4 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF439Q8NDP4 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
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ZNF439Q8NDP4 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF439Q8NDP4 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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ZNF439Q8NDP4 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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ZNF439Q8NDP4 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF439Q8NDP4 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF439Q8NDP4 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF439Q8NDP4 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF439Q8NDP4 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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ZNF439Q8NDP4 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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ZNF439Q8NDP4 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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ZNF439Q8NDP4 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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ZNF439Q8NDP4 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF439Q8NDP4 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF439Q8NDP4 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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ZNF439Q8NDP4 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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ZNF439Q8NDP4 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF439Q8NDP4 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF439Q8NDP4 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF439Q8NDP4 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF439Q8NDP4 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF439Q8NDP4 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF439Q8NDP4 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF439Q8NDP4 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF439Q8NDP4 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF439Q8NDP4 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF439Q8NDP4 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF439Q8NDP4 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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