Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3P4

VPS8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS8Q8N3P4 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
VPS8Q8N3P4 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
VPS8Q8N3P4 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
VPS8Q8N3P4 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
VPS8Q8N3P4 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
VPS8Q8N3P4 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
VPS8Q8N3P4 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
VPS8Q8N3P4 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
VPS8Q8N3P4 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
VPS8Q8N3P4 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
VPS8Q8N3P4 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
VPS8Q8N3P4 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
VPS8Q8N3P4 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
VPS8Q8N3P4 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
VPS8Q8N3P4 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
VPS8Q8N3P4 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
VPS8Q8N3P4 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
VPS8Q8N3P4 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
VPS8Q8N3P4 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
VPS8Q8N3P4 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
VPS8Q8N3P4 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
VPS8Q8N3P4 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
VPS8Q8N3P4 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
VPS8Q8N3P4 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
VPS8Q8N3P4 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
VPS8Q8N3P4 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
VPS8Q8N3P4 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
VPS8Q8N3P4 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
VPS8Q8N3P4 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
VPS8Q8N3P4 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
VPS8Q8N3P4 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
VPS8Q8N3P4 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
VPS8Q8N3P4 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
VPS8Q8N3P4 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
VPS8Q8N3P4 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
VPS8Q8N3P4 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
VPS8Q8N3P4 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
VPS8Q8N3P4 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
VPS8Q8N3P4 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
VPS8Q8N3P4 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
VPS8Q8N3P4 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
VPS8Q8N3P4 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
VPS8Q8N3P4 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
VPS8Q8N3P4 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
VPS8Q8N3P4 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
VPS8Q8N3P4 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
VPS8Q8N3P4 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
VPS8Q8N3P4 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
VPS8Q8N3P4 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
VPS8Q8N3P4 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
VPS8Q8N3P4 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
VPS8Q8N3P4 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
VPS8Q8N3P4 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
VPS8Q8N3P4 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
VPS8Q8N3P4 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
VPS8Q8N3P4 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
VPS8Q8N3P4 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
VPS8Q8N3P4 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
VPS8Q8N3P4 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
VPS8Q8N3P4 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
VPS8Q8N3P4 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
VPS8Q8N3P4 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
VPS8Q8N3P4 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
VPS8Q8N3P4 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
VPS8Q8N3P4 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
VPS8Q8N3P4 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
VPS8Q8N3P4 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
VPS8Q8N3P4 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
VPS8Q8N3P4 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
VPS8Q8N3P4 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
VPS8Q8N3P4 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
VPS8Q8N3P4 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
VPS8Q8N3P4 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
VPS8Q8N3P4 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
VPS8Q8N3P4 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
VPS8Q8N3P4 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
VPS8Q8N3P4 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
VPS8Q8N3P4 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
VPS8Q8N3P4 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
VPS8Q8N3P4 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
VPS8Q8N3P4 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
VPS8Q8N3P4 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
VPS8Q8N3P4 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
VPS8Q8N3P4 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
VPS8Q8N3P4 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
VPS8Q8N3P4 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
VPS8Q8N3P4 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
VPS8Q8N3P4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
VPS8Q8N3P4 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
VPS8Q8N3P4 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
VPS8Q8N3P4 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
VPS8Q8N3P4 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
VPS8Q8N3P4 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
VPS8Q8N3P4 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
VPS8Q8N3P4 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
VPS8Q8N3P4 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
VPS8Q8N3P4 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
VPS8Q8N3P4 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
VPS8Q8N3P4 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
VPS8Q8N3P4 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms