Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2E2

VWDE, von Willebrand factor D and EGF domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWDEQ8N2E2 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
VWDEQ8N2E2 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
VWDEQ8N2E2 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
VWDEQ8N2E2 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
VWDEQ8N2E2 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
VWDEQ8N2E2 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
VWDEQ8N2E2 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
VWDEQ8N2E2 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
VWDEQ8N2E2 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
VWDEQ8N2E2 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
VWDEQ8N2E2 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
VWDEQ8N2E2 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
VWDEQ8N2E2 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
VWDEQ8N2E2 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
VWDEQ8N2E2 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
VWDEQ8N2E2 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
VWDEQ8N2E2 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
VWDEQ8N2E2 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
VWDEQ8N2E2 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
VWDEQ8N2E2 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
VWDEQ8N2E2 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
VWDEQ8N2E2 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
VWDEQ8N2E2 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
VWDEQ8N2E2 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
VWDEQ8N2E2 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
VWDEQ8N2E2 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
VWDEQ8N2E2 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
VWDEQ8N2E2 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
VWDEQ8N2E2 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
VWDEQ8N2E2 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
VWDEQ8N2E2 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
VWDEQ8N2E2 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
VWDEQ8N2E2 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
VWDEQ8N2E2 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
VWDEQ8N2E2 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
VWDEQ8N2E2 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
VWDEQ8N2E2 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
VWDEQ8N2E2 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
VWDEQ8N2E2 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
VWDEQ8N2E2 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
VWDEQ8N2E2 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
VWDEQ8N2E2 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
VWDEQ8N2E2 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
VWDEQ8N2E2 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
VWDEQ8N2E2 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
VWDEQ8N2E2 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
VWDEQ8N2E2 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
VWDEQ8N2E2 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
VWDEQ8N2E2 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
VWDEQ8N2E2 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
VWDEQ8N2E2 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
VWDEQ8N2E2 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
VWDEQ8N2E2 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
VWDEQ8N2E2 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
VWDEQ8N2E2 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
VWDEQ8N2E2 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
VWDEQ8N2E2 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
VWDEQ8N2E2 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
VWDEQ8N2E2 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
VWDEQ8N2E2 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
VWDEQ8N2E2 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
VWDEQ8N2E2 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
VWDEQ8N2E2 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
VWDEQ8N2E2 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
VWDEQ8N2E2 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
VWDEQ8N2E2 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
VWDEQ8N2E2 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
VWDEQ8N2E2 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
VWDEQ8N2E2 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
VWDEQ8N2E2 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
VWDEQ8N2E2 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
VWDEQ8N2E2 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
VWDEQ8N2E2 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
VWDEQ8N2E2 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
VWDEQ8N2E2 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
VWDEQ8N2E2 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
VWDEQ8N2E2 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
VWDEQ8N2E2 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
VWDEQ8N2E2 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
VWDEQ8N2E2 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
VWDEQ8N2E2 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
VWDEQ8N2E2 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
VWDEQ8N2E2 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
VWDEQ8N2E2 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
VWDEQ8N2E2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
VWDEQ8N2E2 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
VWDEQ8N2E2 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
VWDEQ8N2E2 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
VWDEQ8N2E2 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
VWDEQ8N2E2 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
VWDEQ8N2E2 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
VWDEQ8N2E2 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
VWDEQ8N2E2 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
VWDEQ8N2E2 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
VWDEQ8N2E2 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
VWDEQ8N2E2 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
VWDEQ8N2E2 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
VWDEQ8N2E2 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
VWDEQ8N2E2 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
VWDEQ8N2E2 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms