Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUI4

SNX29P2, Putative protein SNX29P2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29P2Q8IUI4 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SNX29P2Q8IUI4 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms