Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
HECW1Q76N89 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
HECW1Q76N89 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
HECW1Q76N89 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
HECW1Q76N89 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
HECW1Q76N89 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
HECW1Q76N89 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
HECW1Q76N89 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
HECW1Q76N89 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
HECW1Q76N89 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
HECW1Q76N89 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
HECW1Q76N89 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
HECW1Q76N89 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
HECW1Q76N89 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
HECW1Q76N89 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
HECW1Q76N89 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
HECW1Q76N89 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
HECW1Q76N89 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
HECW1Q76N89 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
HECW1Q76N89 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
HECW1Q76N89 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
HECW1Q76N89 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
HECW1Q76N89 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
HECW1Q76N89 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
HECW1Q76N89 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
HECW1Q76N89 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
HECW1Q76N89 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
HECW1Q76N89 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
HECW1Q76N89 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
HECW1Q76N89 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
HECW1Q76N89 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
HECW1Q76N89 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
HECW1Q76N89 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
HECW1Q76N89 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
HECW1Q76N89 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
HECW1Q76N89 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
HECW1Q76N89 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
HECW1Q76N89 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
HECW1Q76N89 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
HECW1Q76N89 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
HECW1Q76N89 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
HECW1Q76N89 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
HECW1Q76N89 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
HECW1Q76N89 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
HECW1Q76N89 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
HECW1Q76N89 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
HECW1Q76N89 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
HECW1Q76N89 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
HECW1Q76N89 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
HECW1Q76N89 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
HECW1Q76N89 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
HECW1Q76N89 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
HECW1Q76N89 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
HECW1Q76N89 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
HECW1Q76N89 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
HECW1Q76N89 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
HECW1Q76N89 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
HECW1Q76N89 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
HECW1Q76N89 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
HECW1Q76N89 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
HECW1Q76N89 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
HECW1Q76N89 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
HECW1Q76N89 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
HECW1Q76N89 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
HECW1Q76N89 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
HECW1Q76N89 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.79■■■□□ 2.2
HECW1Q76N89 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
HECW1Q76N89 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
HECW1Q76N89 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
HECW1Q76N89 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
HECW1Q76N89 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
HECW1Q76N89 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
HECW1Q76N89 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
HECW1Q76N89 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
HECW1Q76N89 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
HECW1Q76N89 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
HECW1Q76N89 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
HECW1Q76N89 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
HECW1Q76N89 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
HECW1Q76N89 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
HECW1Q76N89 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
HECW1Q76N89 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
HECW1Q76N89 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
HECW1Q76N89 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
HECW1Q76N89 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
HECW1Q76N89 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
HECW1Q76N89 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
HECW1Q76N89 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
HECW1Q76N89 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
HECW1Q76N89 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
HECW1Q76N89 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
HECW1Q76N89 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
HECW1Q76N89 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
HECW1Q76N89 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
HECW1Q76N89 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
HECW1Q76N89 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
HECW1Q76N89 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
HECW1Q76N89 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
HECW1Q76N89 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
HECW1Q76N89 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms