Protein–RNA interactions for Protein: Q70UQ0

IKBIP, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKBIPQ70UQ0 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IKBIPQ70UQ0 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IKBIPQ70UQ0 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IKBIPQ70UQ0 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IKBIPQ70UQ0 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IKBIPQ70UQ0 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IKBIPQ70UQ0 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IKBIPQ70UQ0 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IKBIPQ70UQ0 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IKBIPQ70UQ0 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
IKBIPQ70UQ0 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IKBIPQ70UQ0 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IKBIPQ70UQ0 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
IKBIPQ70UQ0 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IKBIPQ70UQ0 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
IKBIPQ70UQ0 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
IKBIPQ70UQ0 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
IKBIPQ70UQ0 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
IKBIPQ70UQ0 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
IKBIPQ70UQ0 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
IKBIPQ70UQ0 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IKBIPQ70UQ0 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IKBIPQ70UQ0 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IKBIPQ70UQ0 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IKBIPQ70UQ0 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IKBIPQ70UQ0 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IKBIPQ70UQ0 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IKBIPQ70UQ0 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IKBIPQ70UQ0 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IKBIPQ70UQ0 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
IKBIPQ70UQ0 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IKBIPQ70UQ0 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IKBIPQ70UQ0 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IKBIPQ70UQ0 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
IKBIPQ70UQ0 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IKBIPQ70UQ0 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
IKBIPQ70UQ0 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IKBIPQ70UQ0 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
IKBIPQ70UQ0 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IKBIPQ70UQ0 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IKBIPQ70UQ0 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IKBIPQ70UQ0 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IKBIPQ70UQ0 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
IKBIPQ70UQ0 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IKBIPQ70UQ0 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IKBIPQ70UQ0 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IKBIPQ70UQ0 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IKBIPQ70UQ0 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
IKBIPQ70UQ0 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
IKBIPQ70UQ0 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IKBIPQ70UQ0 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IKBIPQ70UQ0 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IKBIPQ70UQ0 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IKBIPQ70UQ0 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
IKBIPQ70UQ0 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IKBIPQ70UQ0 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IKBIPQ70UQ0 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IKBIPQ70UQ0 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IKBIPQ70UQ0 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IKBIPQ70UQ0 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IKBIPQ70UQ0 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IKBIPQ70UQ0 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IKBIPQ70UQ0 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IKBIPQ70UQ0 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IKBIPQ70UQ0 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IKBIPQ70UQ0 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IKBIPQ70UQ0 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
IKBIPQ70UQ0 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IKBIPQ70UQ0 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IKBIPQ70UQ0 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IKBIPQ70UQ0 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IKBIPQ70UQ0 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IKBIPQ70UQ0 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IKBIPQ70UQ0 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IKBIPQ70UQ0 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IKBIPQ70UQ0 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IKBIPQ70UQ0 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IKBIPQ70UQ0 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IKBIPQ70UQ0 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IKBIPQ70UQ0 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
IKBIPQ70UQ0 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
IKBIPQ70UQ0 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
IKBIPQ70UQ0 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IKBIPQ70UQ0 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IKBIPQ70UQ0 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IKBIPQ70UQ0 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IKBIPQ70UQ0 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IKBIPQ70UQ0 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IKBIPQ70UQ0 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IKBIPQ70UQ0 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IKBIPQ70UQ0 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IKBIPQ70UQ0 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IKBIPQ70UQ0 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IKBIPQ70UQ0 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
IKBIPQ70UQ0 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
IKBIPQ70UQ0 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
IKBIPQ70UQ0 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IKBIPQ70UQ0 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IKBIPQ70UQ0 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
IKBIPQ70UQ0 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms