Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRK6

CCDC73, Coiled-coil domain-containing protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC73Q6ZRK6 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC73Q6ZRK6 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms