Protein–RNA interactions for Protein: Q6VMQ6

ATF7IP, Activating transcription factor 7-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF7IPQ6VMQ6 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATF7IPQ6VMQ6 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ATF7IPQ6VMQ6 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATF7IPQ6VMQ6 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATF7IPQ6VMQ6 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATF7IPQ6VMQ6 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATF7IPQ6VMQ6 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATF7IPQ6VMQ6 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATF7IPQ6VMQ6 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATF7IPQ6VMQ6 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATF7IPQ6VMQ6 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ATF7IPQ6VMQ6 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATF7IPQ6VMQ6 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATF7IPQ6VMQ6 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATF7IPQ6VMQ6 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ATF7IPQ6VMQ6 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATF7IPQ6VMQ6 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATF7IPQ6VMQ6 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATF7IPQ6VMQ6 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATF7IPQ6VMQ6 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATF7IPQ6VMQ6 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATF7IPQ6VMQ6 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATF7IPQ6VMQ6 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATF7IPQ6VMQ6 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATF7IPQ6VMQ6 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATF7IPQ6VMQ6 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATF7IPQ6VMQ6 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATF7IPQ6VMQ6 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATF7IPQ6VMQ6 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATF7IPQ6VMQ6 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ATF7IPQ6VMQ6 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATF7IPQ6VMQ6 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATF7IPQ6VMQ6 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATF7IPQ6VMQ6 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATF7IPQ6VMQ6 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATF7IPQ6VMQ6 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATF7IPQ6VMQ6 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATF7IPQ6VMQ6 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ATF7IPQ6VMQ6 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATF7IPQ6VMQ6 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATF7IPQ6VMQ6 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATF7IPQ6VMQ6 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATF7IPQ6VMQ6 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATF7IPQ6VMQ6 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATF7IPQ6VMQ6 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATF7IPQ6VMQ6 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATF7IPQ6VMQ6 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATF7IPQ6VMQ6 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATF7IPQ6VMQ6 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATF7IPQ6VMQ6 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATF7IPQ6VMQ6 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATF7IPQ6VMQ6 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATF7IPQ6VMQ6 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATF7IPQ6VMQ6 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATF7IPQ6VMQ6 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATF7IPQ6VMQ6 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATF7IPQ6VMQ6 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATF7IPQ6VMQ6 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATF7IPQ6VMQ6 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ATF7IPQ6VMQ6 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATF7IPQ6VMQ6 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATF7IPQ6VMQ6 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATF7IPQ6VMQ6 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATF7IPQ6VMQ6 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATF7IPQ6VMQ6 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATF7IPQ6VMQ6 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATF7IPQ6VMQ6 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATF7IPQ6VMQ6 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATF7IPQ6VMQ6 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATF7IPQ6VMQ6 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATF7IPQ6VMQ6 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATF7IPQ6VMQ6 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATF7IPQ6VMQ6 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATF7IPQ6VMQ6 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATF7IPQ6VMQ6 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATF7IPQ6VMQ6 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATF7IPQ6VMQ6 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATF7IPQ6VMQ6 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATF7IPQ6VMQ6 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATF7IPQ6VMQ6 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATF7IPQ6VMQ6 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATF7IPQ6VMQ6 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATF7IPQ6VMQ6 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATF7IPQ6VMQ6 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ATF7IPQ6VMQ6 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATF7IPQ6VMQ6 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATF7IPQ6VMQ6 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATF7IPQ6VMQ6 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATF7IPQ6VMQ6 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATF7IPQ6VMQ6 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ATF7IPQ6VMQ6 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ATF7IPQ6VMQ6 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ATF7IPQ6VMQ6 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ATF7IPQ6VMQ6 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ATF7IPQ6VMQ6 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ATF7IPQ6VMQ6 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ATF7IPQ6VMQ6 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ATF7IPQ6VMQ6 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ATF7IPQ6VMQ6 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATF7IPQ6VMQ6 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms