Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWJ1

TMCO3, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 677 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO3Q6UWJ1 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMCO3Q6UWJ1 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMCO3Q6UWJ1 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMCO3Q6UWJ1 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMCO3Q6UWJ1 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMCO3Q6UWJ1 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMCO3Q6UWJ1 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMCO3Q6UWJ1 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMCO3Q6UWJ1 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMCO3Q6UWJ1 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMCO3Q6UWJ1 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMCO3Q6UWJ1 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMCO3Q6UWJ1 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TMCO3Q6UWJ1 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMCO3Q6UWJ1 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TMCO3Q6UWJ1 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TMCO3Q6UWJ1 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMCO3Q6UWJ1 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMCO3Q6UWJ1 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMCO3Q6UWJ1 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMCO3Q6UWJ1 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMCO3Q6UWJ1 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TMCO3Q6UWJ1 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMCO3Q6UWJ1 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMCO3Q6UWJ1 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMCO3Q6UWJ1 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMCO3Q6UWJ1 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMCO3Q6UWJ1 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMCO3Q6UWJ1 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMCO3Q6UWJ1 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMCO3Q6UWJ1 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMCO3Q6UWJ1 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMCO3Q6UWJ1 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMCO3Q6UWJ1 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMCO3Q6UWJ1 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMCO3Q6UWJ1 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMCO3Q6UWJ1 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMCO3Q6UWJ1 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMCO3Q6UWJ1 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMCO3Q6UWJ1 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMCO3Q6UWJ1 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMCO3Q6UWJ1 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMCO3Q6UWJ1 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMCO3Q6UWJ1 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMCO3Q6UWJ1 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMCO3Q6UWJ1 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMCO3Q6UWJ1 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMCO3Q6UWJ1 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMCO3Q6UWJ1 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMCO3Q6UWJ1 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMCO3Q6UWJ1 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMCO3Q6UWJ1 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMCO3Q6UWJ1 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMCO3Q6UWJ1 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMCO3Q6UWJ1 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMCO3Q6UWJ1 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMCO3Q6UWJ1 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMCO3Q6UWJ1 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMCO3Q6UWJ1 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMCO3Q6UWJ1 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMCO3Q6UWJ1 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TMCO3Q6UWJ1 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMCO3Q6UWJ1 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMCO3Q6UWJ1 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMCO3Q6UWJ1 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TMCO3Q6UWJ1 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMCO3Q6UWJ1 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMCO3Q6UWJ1 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMCO3Q6UWJ1 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TMCO3Q6UWJ1 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMCO3Q6UWJ1 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMCO3Q6UWJ1 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMCO3Q6UWJ1 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMCO3Q6UWJ1 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMCO3Q6UWJ1 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMCO3Q6UWJ1 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMCO3Q6UWJ1 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMCO3Q6UWJ1 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMCO3Q6UWJ1 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMCO3Q6UWJ1 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMCO3Q6UWJ1 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMCO3Q6UWJ1 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMCO3Q6UWJ1 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMCO3Q6UWJ1 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMCO3Q6UWJ1 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMCO3Q6UWJ1 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMCO3Q6UWJ1 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMCO3Q6UWJ1 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMCO3Q6UWJ1 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMCO3Q6UWJ1 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMCO3Q6UWJ1 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMCO3Q6UWJ1 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMCO3Q6UWJ1 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMCO3Q6UWJ1 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMCO3Q6UWJ1 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMCO3Q6UWJ1 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMCO3Q6UWJ1 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMCO3Q6UWJ1 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMCO3Q6UWJ1 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMCO3Q6UWJ1 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
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