Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1M3

LLGL2, Lethal(2) giant larvae protein homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,020 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LLGL2Q6P1M3 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
LLGL2Q6P1M3 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LLGL2Q6P1M3 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LLGL2Q6P1M3 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LLGL2Q6P1M3 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LLGL2Q6P1M3 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LLGL2Q6P1M3 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LLGL2Q6P1M3 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LLGL2Q6P1M3 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LLGL2Q6P1M3 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LLGL2Q6P1M3 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LLGL2Q6P1M3 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LLGL2Q6P1M3 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LLGL2Q6P1M3 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LLGL2Q6P1M3 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LLGL2Q6P1M3 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LLGL2Q6P1M3 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LLGL2Q6P1M3 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LLGL2Q6P1M3 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LLGL2Q6P1M3 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LLGL2Q6P1M3 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LLGL2Q6P1M3 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LLGL2Q6P1M3 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LLGL2Q6P1M3 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LLGL2Q6P1M3 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LLGL2Q6P1M3 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LLGL2Q6P1M3 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LLGL2Q6P1M3 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LLGL2Q6P1M3 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LLGL2Q6P1M3 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LLGL2Q6P1M3 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LLGL2Q6P1M3 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LLGL2Q6P1M3 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LLGL2Q6P1M3 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LLGL2Q6P1M3 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LLGL2Q6P1M3 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LLGL2Q6P1M3 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LLGL2Q6P1M3 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
LLGL2Q6P1M3 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LLGL2Q6P1M3 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LLGL2Q6P1M3 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LLGL2Q6P1M3 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LLGL2Q6P1M3 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LLGL2Q6P1M3 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LLGL2Q6P1M3 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LLGL2Q6P1M3 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LLGL2Q6P1M3 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LLGL2Q6P1M3 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LLGL2Q6P1M3 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LLGL2Q6P1M3 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LLGL2Q6P1M3 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LLGL2Q6P1M3 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LLGL2Q6P1M3 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LLGL2Q6P1M3 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LLGL2Q6P1M3 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LLGL2Q6P1M3 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LLGL2Q6P1M3 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LLGL2Q6P1M3 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LLGL2Q6P1M3 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LLGL2Q6P1M3 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LLGL2Q6P1M3 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
LLGL2Q6P1M3 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
LLGL2Q6P1M3 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
LLGL2Q6P1M3 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LLGL2Q6P1M3 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LLGL2Q6P1M3 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
LLGL2Q6P1M3 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LLGL2Q6P1M3 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LLGL2Q6P1M3 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LLGL2Q6P1M3 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LLGL2Q6P1M3 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LLGL2Q6P1M3 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
LLGL2Q6P1M3 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LLGL2Q6P1M3 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
LLGL2Q6P1M3 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LLGL2Q6P1M3 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LLGL2Q6P1M3 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LLGL2Q6P1M3 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LLGL2Q6P1M3 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
LLGL2Q6P1M3 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LLGL2Q6P1M3 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LLGL2Q6P1M3 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LLGL2Q6P1M3 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LLGL2Q6P1M3 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LLGL2Q6P1M3 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LLGL2Q6P1M3 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LLGL2Q6P1M3 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LLGL2Q6P1M3 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LLGL2Q6P1M3 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LLGL2Q6P1M3 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LLGL2Q6P1M3 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LLGL2Q6P1M3 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LLGL2Q6P1M3 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LLGL2Q6P1M3 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
LLGL2Q6P1M3 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
LLGL2Q6P1M3 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
LLGL2Q6P1M3 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LLGL2Q6P1M3 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LLGL2Q6P1M3 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LLGL2Q6P1M3 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms