Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CENPPQ6IPU0 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CENPPQ6IPU0 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CENPPQ6IPU0 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CENPPQ6IPU0 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CENPPQ6IPU0 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CENPPQ6IPU0 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CENPPQ6IPU0 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CENPPQ6IPU0 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CENPPQ6IPU0 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CENPPQ6IPU0 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CENPPQ6IPU0 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CENPPQ6IPU0 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CENPPQ6IPU0 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CENPPQ6IPU0 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CENPPQ6IPU0 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CENPPQ6IPU0 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CENPPQ6IPU0 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CENPPQ6IPU0 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CENPPQ6IPU0 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CENPPQ6IPU0 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CENPPQ6IPU0 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CENPPQ6IPU0 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CENPPQ6IPU0 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CENPPQ6IPU0 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CENPPQ6IPU0 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CENPPQ6IPU0 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CENPPQ6IPU0 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CENPPQ6IPU0 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CENPPQ6IPU0 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CENPPQ6IPU0 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CENPPQ6IPU0 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CENPPQ6IPU0 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CENPPQ6IPU0 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CENPPQ6IPU0 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CENPPQ6IPU0 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CENPPQ6IPU0 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CENPPQ6IPU0 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CENPPQ6IPU0 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CENPPQ6IPU0 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CENPPQ6IPU0 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CENPPQ6IPU0 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CENPPQ6IPU0 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CENPPQ6IPU0 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CENPPQ6IPU0 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CENPPQ6IPU0 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CENPPQ6IPU0 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CENPPQ6IPU0 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CENPPQ6IPU0 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CENPPQ6IPU0 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CENPPQ6IPU0 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CENPPQ6IPU0 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CENPPQ6IPU0 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CENPPQ6IPU0 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CENPPQ6IPU0 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CENPPQ6IPU0 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CENPPQ6IPU0 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CENPPQ6IPU0 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CENPPQ6IPU0 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CENPPQ6IPU0 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CENPPQ6IPU0 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CENPPQ6IPU0 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CENPPQ6IPU0 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CENPPQ6IPU0 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CENPPQ6IPU0 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CENPPQ6IPU0 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CENPPQ6IPU0 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CENPPQ6IPU0 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CENPPQ6IPU0 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CENPPQ6IPU0 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CENPPQ6IPU0 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPPQ6IPU0 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPPQ6IPU0 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPPQ6IPU0 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPPQ6IPU0 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPPQ6IPU0 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPPQ6IPU0 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPPQ6IPU0 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPPQ6IPU0 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPPQ6IPU0 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPPQ6IPU0 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPPQ6IPU0 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPPQ6IPU0 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPPQ6IPU0 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPPQ6IPU0 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPPQ6IPU0 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPPQ6IPU0 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPPQ6IPU0 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPPQ6IPU0 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPPQ6IPU0 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPPQ6IPU0 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPPQ6IPU0 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPPQ6IPU0 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPPQ6IPU0 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPPQ6IPU0 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPPQ6IPU0 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CENPPQ6IPU0 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CENPPQ6IPU0 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CENPPQ6IPU0 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CENPPQ6IPU0 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms