Protein–RNA interactions for Protein: Q6EEV6

SUMO4, Small ubiquitin-related modifier 4, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO4Q6EEV6 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SUMO4Q6EEV6 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SUMO4Q6EEV6 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SUMO4Q6EEV6 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SUMO4Q6EEV6 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SUMO4Q6EEV6 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SUMO4Q6EEV6 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SUMO4Q6EEV6 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SUMO4Q6EEV6 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SUMO4Q6EEV6 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SUMO4Q6EEV6 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SUMO4Q6EEV6 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SUMO4Q6EEV6 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SUMO4Q6EEV6 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SUMO4Q6EEV6 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SUMO4Q6EEV6 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SUMO4Q6EEV6 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SUMO4Q6EEV6 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SUMO4Q6EEV6 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SUMO4Q6EEV6 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SUMO4Q6EEV6 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SUMO4Q6EEV6 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SUMO4Q6EEV6 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SUMO4Q6EEV6 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SUMO4Q6EEV6 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SUMO4Q6EEV6 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SUMO4Q6EEV6 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SUMO4Q6EEV6 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SUMO4Q6EEV6 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SUMO4Q6EEV6 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SUMO4Q6EEV6 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SUMO4Q6EEV6 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SUMO4Q6EEV6 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SUMO4Q6EEV6 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SUMO4Q6EEV6 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SUMO4Q6EEV6 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SUMO4Q6EEV6 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SUMO4Q6EEV6 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SUMO4Q6EEV6 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SUMO4Q6EEV6 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SUMO4Q6EEV6 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SUMO4Q6EEV6 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SUMO4Q6EEV6 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SUMO4Q6EEV6 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SUMO4Q6EEV6 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SUMO4Q6EEV6 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SUMO4Q6EEV6 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SUMO4Q6EEV6 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SUMO4Q6EEV6 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SUMO4Q6EEV6 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SUMO4Q6EEV6 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SUMO4Q6EEV6 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SUMO4Q6EEV6 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
SUMO4Q6EEV6 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SUMO4Q6EEV6 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SUMO4Q6EEV6 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SUMO4Q6EEV6 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SUMO4Q6EEV6 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SUMO4Q6EEV6 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SUMO4Q6EEV6 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SUMO4Q6EEV6 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SUMO4Q6EEV6 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SUMO4Q6EEV6 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SUMO4Q6EEV6 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SUMO4Q6EEV6 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SUMO4Q6EEV6 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SUMO4Q6EEV6 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SUMO4Q6EEV6 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SUMO4Q6EEV6 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SUMO4Q6EEV6 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SUMO4Q6EEV6 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SUMO4Q6EEV6 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SUMO4Q6EEV6 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SUMO4Q6EEV6 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SUMO4Q6EEV6 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SUMO4Q6EEV6 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SUMO4Q6EEV6 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SUMO4Q6EEV6 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SUMO4Q6EEV6 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SUMO4Q6EEV6 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SUMO4Q6EEV6 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SUMO4Q6EEV6 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SUMO4Q6EEV6 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SUMO4Q6EEV6 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SUMO4Q6EEV6 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SUMO4Q6EEV6 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SUMO4Q6EEV6 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SUMO4Q6EEV6 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SUMO4Q6EEV6 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SUMO4Q6EEV6 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SUMO4Q6EEV6 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SUMO4Q6EEV6 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SUMO4Q6EEV6 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SUMO4Q6EEV6 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SUMO4Q6EEV6 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SUMO4Q6EEV6 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SUMO4Q6EEV6 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SUMO4Q6EEV6 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SUMO4Q6EEV6 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SUMO4Q6EEV6 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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